Unet 背景介绍
Unet 发表于 2015 年,属于 FCN 的一种变体,想了解 FCN 可以看我的另一篇 FCN 全卷积网络论文阅读及代码实现 。Unet 的初衷是为了解决生物医学图像方面的问题,由于效果确实很好后来也被广泛的应用在语义分割的各个方向,比如卫星图像分割,工业瑕疵检测等。
Unet 跟 FCN 都是 Encoder-Decoder 结构,结构简单但很有效。Encoder 负责特征提取,你可以将自己熟悉的各种特征提取网络放在这个位置。由于在医学方面,样本收集较为困难,作者为了解决这个问题,应用了图像增强的方法,在数据集有限的情况下获得了不错的精度。
Unet 网络结构与细节
-
Encoder
网络结构
如上图,Unet 网络结构是对称的,形似英文字母 U 所以被称为 Unet。整张图都是由蓝/白色框与各种颜色的箭头组成,其中,蓝/白色框表示 feature map;蓝色箭头表示 3x3 卷积,用于特征提取;灰色箭头表示 skip-connection,用于特征融合;红色箭头表示池化 pooling,用于降低维度;绿色箭头表示上采样 upsample,用于恢复维度;青色箭头表示 1x1 卷积,用于输出结果。
可能你会问为啥是 5 层而不是 4 层或者 6 层,emmm,这应该去问作者本人,可能对于当时作者拿到的数据集来说,这个层数的表现更好,但不代表所有的数据集这个结构都适合。我们该多关注这种 Encoder-Decoder 的设计思想,具体实现则应该因数据集而异。
Encoder 由卷积操作和下采样操作组成,文中所用的卷积结构统一为 3x3 的卷积核,padding 为 0 ,striding 为 1。没有 padding 所以每次卷积之后 feature map 的 H 和 W 变小了,在 skip-connection 时要注意 feature map 的维度(其实也可以将 padding 设置为 1 避免维度不对应问题),pytorch 代码:
nn.Sequential(nn.Conv2d(in_channels, out_channels, 3),
nn.BatchNorm2d(out_channels),
nn.ReLU(inplace=True))
上述的两次卷积之后是一个 stride 为 2 的 max pooling,输出大小变为 1/2 *(H, W):
max-poolingpytorch 代码:
nn.MaxPool2d(kernel_size=2, stride=2)
上面的步骤重复 5 次,最后一次没有 max-pooling,直接将得到的 feature map 送入 Decoder。
- Decoder
feature map 经过 Decoder 恢复原始分辨率,该过程除了卷积比较关键的步骤就是 upsampling 与 skip-connection。
Upsampling 上采样常用的方式有两种:1.FCN 中介绍的反卷积;2. 插值。这里介绍文中使用的插值方式。在插值实现方式中,bilinear 双线性插值的综合表现较好也较为常见 。
双线性插值的计算过程没有需要学习的参数,实际就是套公式,这里举个例子方便大家理解(例子介绍的是参数 align_corners 为 Fasle 的情况)。
image例子中是将一个 2x2 的矩阵通过插值的方式得到 4x4 的矩阵,那么将 2x2 的矩阵称为源矩阵,4x4 的矩阵称为目标矩阵。双线性插值中,目标点的值是由离他最近的 4 个点的值计算得到的,我们首先介绍如何找到目标点周围的 4 个点,以 P2 为例。
image第一个公式,目标矩阵到源矩阵的坐标映射:
为了找到那 4 个点,首先要找到目标点在源矩阵中的相对位置,上面的公式就是用来算这个的。P2 在目标矩阵中的坐标是 (0, 1),对应到源矩阵中的坐标就是 (-0.25, 0.25)。坐标里面居然有小数跟负数,不急我们一个一个来处理。我们知道双线性插值是从坐标周围的 4 个点来计算该坐标的值,(-0.25, 0.25) 这个点周围的 4 个点是(-1, 0), (-1, 1), (0, 0), (0, 1)。为了找到负数坐标点,我们将源矩阵扩展为下面的形式,中间红色的部分为源矩阵。
我们规定 f(i, j) 表示 (i, j)坐标点处的像素值,对于计算出来的对应的坐标,我们统一写成 (i+u, j+v) 的形式。那么这时 i=-1, u=0.75, j=0, v=0.25。把这 4 个点单独画出来,可以看到目标点 P2 对应到源矩阵中的相对位置。
image第二个公式,也是最后一个。
f(i + u, j + v) = (1 - u) (1 - v) f(i, j) + (1 - u) v f(i, j + 1) + u (1 - v) f(i + 1, j) + u v f(i + 1, j + 1)
目标点的像素值就是周围 4 个点像素值的加权和,明显可以看出离得近的权值比较大例如 (0, 0) 点的权值就是 0.750.75,离得远的如 (-1, 1) 权值就比较小,为 0.250.25,这也比较符合常理吧。把值带入计算就可以得到 P2 点的值了,结果是 12.5 与代码吻合上了,nice。
pytorch 里使用 bilinear 插值:
nn.Upsample(scale_factor=2, mode='bilinear')
CNN 网络要想获得好效果,skip-connection 基本必不可少。Unet 中这一关键步骤融合了底层信息的位置信息与深层特征的语义信息,pytorch 代码:
torch.cat([low_layer_features, deep_layer_features], dim=1)
这里需要注意的是,FCN 中深层信息与浅层信息融合是通过对应像素相加的方式,而 Unet 是通过拼接的方式。
那么这两者有什么区别呢,其实 在 ResNet 与 DenseNet 中也有一样的区别,Resnet 使用了对应值相加,DenseNet 使用了拼接。个人理解在相加的方式下,feature map 的维度没有变化,但每个维度都包含了更多特征,对于普通的分类任务这种不需要从 feature map 复原到原始分辨率的任务来说,这是一个高效的选择;而拼接则保留了更多的维度/位置 信息,这使得后面的 layer 可以在浅层特征与深层特征自由选择,这对语义分割任务来说更有优势。
小结
Unet 基于 Encoder-Decoder 结构,通过拼接的方式实现特征融合,结构简明且稳定,如果你有语义分割的问题,尤其在样本数据量不大的情况下,十分推荐一试。
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