最近使用了CLC做分析,发现收费软件的速度真的是很快哇,而且可视化界面设计的很不错。但是我们也不能太依赖这些收费的软件,比如我先在得到了每个样本的vcf文件,我想合并,这个软件就实现不了,这不,还是得学一点其他技术。
我网上查了查,发现可以使用bcftools
分成三步走
1.压缩vcf文件
压缩
-
建立索引
index -
合并
合并
这个只是我做了个test,因为我的样本比较多,所以我后续还是写个脚本批量完成的
最近使用了CLC做分析,发现收费软件的速度真的是很快哇,而且可视化界面设计的很不错。但是我们也不能太依赖这些收费的软件,比如我先在得到了每个样本的vcf文件,我想合并,这个软件就实现不了,这不,还是得学一点其他技术。
我网上查了查,发现可以使用bcftools
分成三步走
1.压缩vcf文件
建立索引
合并
这个只是我做了个test,因为我的样本比较多,所以我后续还是写个脚本批量完成的
本文标题:2018-10-05 如何把vcf 文件合并
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