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2018-10-05 如何把vcf 文件合并

2018-10-05 如何把vcf 文件合并

作者: 小郑的学习笔记 | 来源:发表于2018-10-05 13:33 被阅读0次

    最近使用了CLC做分析,发现收费软件的速度真的是很快哇,而且可视化界面设计的很不错。但是我们也不能太依赖这些收费的软件,比如我先在得到了每个样本的vcf文件,我想合并,这个软件就实现不了,这不,还是得学一点其他技术。

    我网上查了查,发现可以使用bcftools

    分成三步走
    1.压缩vcf文件


    压缩
    1. 建立索引


      index
    2. 合并


      合并

    这个只是我做了个test,因为我的样本比较多,所以我后续还是写个脚本批量完成的

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