seqtk subseq all.contigs.fa aim_hit_contig.txt> all_hit.contig.fa
小编分享一个从fasta中提取序列的perl脚本(需要安装bioperl):
提取出符合条件的20行序列grep -A20 + Gene ID + fasta
参考: https://www.biostars.org/p/127141/快速计算fasta序列长度的方法 Ti...
def get_trans(intrans, outtrans): with open(intrans, "r"...
看两个fasta的格式,一个是单行的序列,一个是格式化后的序列 题目:提取id1和id2的序列,并组成fasta格...
把要提取的 序列 ID 写入 id.txt , 一行一个ID 1.seqkit 2.seqtk
如题,目的是从fasta文件中批量提取特定的基因序列.实现办法有几种: perl脚本:CSDN博主「little^...
将gbk格式文件转换成fasta格式文件 将多个fasta序列中提取含有'Homo sapiens'的序列 请关注...
最近有个老师在做基于十多个保守基因的进化树分析,需要从几十个基因组中分别提取出特定的基因序列,如果对于每个...
用法1 用法2 以上两种,结果都储存在gen.txt中 对于没找的基因序列,在基因名字下面用 no found 代替
本文标题:如何提取特定id的fasta序列
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/umuhcdtx.html
网友评论