tensorflow读取机制图解
我们必须要把数据先读入后才能进行计算,假设读入用时0.1s,计算用时0.9s,那么就意味着每过1s,GPU都会有0.1s无事可做,这就大大降低了运算的效率。
解决这个问题方法就是将读入数据和计算分别放在两个线程中,将数据读入内存的一个队列,如下图所示:
image读取线程源源不断地将文件系统中的图片读入到一个内存的队列中,而负责计算的是另一个线程,计算需要数据时,直接从内存队列中取就可以了。这样就可以解决GPU因为IO而空闲的问题!
在tensorflow中,为了方便管理,在内存队列前又添加了一层所谓的“文件名队列”。tensorflow使用文件名队列+内存队列双队列的形式读入文件,可以很好地管理epoch。下面我们用图片的形式来说明这个机制的运行方式。
image image如果再尝试读入,系统由于检测到了“结束”,就会自动抛出一个异常(OutOfRange)。外部捕捉到这个异常后就可以结束程序了。这就是tensorflow中读取数据的基本机制。
tensorflow读取数据机制的对应函数
对于文件名队列,我们使用tf.train.string_input_producer函数。这个函数需要传入一个文件名list,系统会自动将它转为一个文件名队列。tf.train.string_input_producer还有两个重要的参数,一个是num_epochs,表示epoch数。另外一个就是shuffle是指在一个epoch内文件的顺序是否被打乱。
在tensorflow中,内存队列不需要我们自己建立,我们只需要使用reader对象从文件名队列中读取数据就可以了。
在我们使用tf.train.string_input_producer创建文件名队列后,整个系统其实还是处于“停滞状态”的,也就是说,我们文件名并没有真正被加入到队列中,此时如果我们开始计算,因为内存队列中什么也没有,计算单元就会一直等待,导致整个系统被阻塞。使用tf.train.start_queue_runners之后,才会启动填充队列的线程,这时系统就不再“停滞”。此后计算单元就可以拿到数据并进行计算,整个程序也就跑起来了。
reader每次读取一张图片并保存。
import tensorflow as tf
# 新建一个Session
with tf.Session() as sess:
# 我们要读三幅图片A.jpg, B.jpg, C.jpg
filename = ['A.jpg', 'B.jpg', 'C.jpg']
# string_input_producer会产生一个文件名队列
filename_queue = tf.train.string_input_producer(filename, shuffle=False, num_epochs=5)
# reader从文件名队列中读数据。对应的方法是reader.read
reader = tf.WholeFileReader()
key, value = reader.read(filename_queue)
# tf.train.string_input_producer定义了一个epoch变量,要对它进行初始化
tf.local_variables_initializer().run()
# 使用start_queue_runners之后,才会开始填充队列
threads = tf.train.start_queue_runners(sess=sess)
i = 0
while True:
i += 1
# 获取图片数据并保存
image_data = sess.run(value)
with open('read/test_%d.jpg' % i, 'wb') as f:
f.write(image_data)
demo
好了,结合之前的tensorflow学习笔记-队列和线程管理, 我们就可以写个像样的多线程队列读取文件的代码了。
文件准备:
$ echo -e "Alpha1,A1\nAlpha2,A2\nAlpha3,A3" > A.csv
$ echo -e "Bee1,B1\nBee2,B2\nBee3,B3" > B.csv
$ echo -e "Sea1,C1\nSea2,C2\nSea3,C3" > C.csv
$ cat A.csv
Alpha1,A1
Alpha2,A2
Alpha3,A3
import tensorflow as tf
# 生成一个先入先出队列和一个QueueRunner
filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv']
filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False)
# 定义Reader
reader = tf.TextLineReader()
key, value = reader.read(filename_queue)
# 定义Decoder
example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']])
# 运行Graph
with tf.Session() as sess:
coord = tf.train.Coordinator() #创建一个协调器,管理线程
threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) #启动QueueRunner, 此时文件名队列已经进队。
for i in range(10):
print example.eval() #取样本的时候,一个Reader先从文件名队列中取出文件名,读出数据,Decoder解析后进入样本队列。
coord.request_stop()
coord.join(threads)
# outpt
Alpha1
Alpha2
Alpha3
Bee1
Bee2
Bee3
Sea1
Sea2
Sea3
Alpha1
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