基因检测的意义

问：什么是基因？
答：基因就是片段化的DNA。DNA叫做脱氧核糖核酸是双螺旋结构，是我们人类遗传物质的载体。也就是说我们每个人的不同，其实就是DNA序列的不同所导致的。因为是有四种碱基组成的，分别是A，T，C，G。基因检测，说白了就是检测基因的ATCG是怎么排列的。

问：基因的数量？
答：人类的基因一共有2万多种。但绝大部分基因的实际意义目前还并不明确。在2万多个基因当中，有600多个是跟肿瘤的发生发展相关的。有100多种适合药物的疗效相关的。其中。20种左右适合靶向药物的疗效相关的。

问：检测的基因数量越多越好吗？
答：并不是这样，关键是看要解决什么问题。如果只想看靶向药物的效果，那检测20个基因左右就可以了。如果想看所有癌症类型，所有意义明确的药物当中有哪些可能敏感。那检测100多个基因就足够了，100多个基因的性价比是最高的，因为这100多个基因已经涵盖了所有的癌症类型所有的意义明确的药物位点，包括靶向药、化疗药、免疫治疗药。如果比较重视免疫治疗，想尽可能的预测全，那是一定要检测600多个基因的。因为只有600多个基因才能够检测TMB，也叫肿瘤突变负荷，以及免疫治疗超进展MDM2和MDM4，和一些免疫治疗正相关的基因位点POLE和POLD1。

问：全基因组，全外显子，热点突变有什么区别？
答：全基因组是指把人类的2万多个基因全部检测了，这种情况下因为要求检测基因的覆盖率高，所以测序的深度相对比较差，如果用于疗效预测的体细胞突变检测，这种方法的准确性并不推荐。所以市面上看到的全基因检测用于预测药物的疗效或者比较大的panel预测，其实都是噱头，从临床意义来讲经不起推敲。因为测序的时候，覆盖越广，深度肯定就相对差。而预测药物疗效，要求的是准确。600多个基因的全外检测是最理想的。
基因的区域分为外显子和内含子。其中外显子的意义更明确，顾名思义，外显就是和细胞的功能，生物的状态直接相关的。而内含子的具体意义相对来讲研究的并不特别明确。从药物疗效预测的目的来讲，检测全外已经是绰绰有余了（全外也只是因为检测TMB需要全外），没有必要检测全基因组。
热点突变和全外区别在于，热点检测的是意义明确的，已知和药物疗效相关的位点。而全外是包括了热点突变和非热点突变。非热点突变也就是意义尚不明确的突变。但是为什么600多个基因又要检测全外，不是浪费吗？这是因为如果要检测肿瘤突变负荷，也就是TMB，是一定要检测全外的。这是技术要求。

问：什么是体系突变和胚系突变？
答：体系突变是后天发生的突变，是少部分的细胞才具有的，因此检测体系突变的时候对技术的要求更高，因为只有少数细胞才会发生体系突变。而和药物疗效相关的，一般都是体系突变。所以说药物疗效的预测一般都是体系突变相关。
胚系突变是与生俱来的，是在生殖细胞的时候就已经携带的突变，它存在于所有类型的所有的细胞当中。因此检测会更容易。测序深度要求相对比较低。遗传风险讲的都是胚系突变。

问：野生，突变，变异频率是什么意思？
答：野生型，指的是检测这个基因的时候没有发生突变就叫野生型。
突变型，指的是 检测的时候这个基因发生了突变，所以就叫突变型。
变异频率指的是，发生这个突变的基因在等位基因中所占的比例，可以从另一个角度理解，是发生突变的细胞在所有细胞中占的比例。数值越大，说明这种基因突变的细胞数量越多。

问：突变，插入，缺失，扩增，融合，拷贝数变异是什么意思？
答：基因突变，指的是基因的碱基，就是之前讲到的ATCG发生变化，可以分为点突变，插入，缺失，很容易从字面理解。
拷贝数变异指的是基因的DNA复制时有没有异常，如果变多了，就是扩增了。
融合指的是另外一种基因变异，不同于点突变，插入和缺失，是发生了融合。从字面理解即可。

问：基因变异就是基因突变吗？
答：基因变异包括：基因突变、基因融合、基因拷贝数异常（增多就是基因扩增）等。
基因突变包括：点突变、插入、缺失。

问：为什么要检测基因？
答：通过检测基因，明确每个人的基因个体差异，为每一个患者本人找到最适合他本人的治疗药物，从而避免反复试药、避免对无效、甚至有害的治疗，提高治疗有效率，延长生存期。

问：为什么基因可以预测药物疗效？
答：每个人的个体差异导致同一种药，有的人有效，有的人却无效。这种差异的本质原因是基因差异。就靶向药而言，靶向药被研发的原理，就是特定靶向杀伤某种特定基因突变的肿瘤细胞。所以，如果没有携带特定的突变，也就是没有特定的靶点，靶向药是不可能有效的。免疫治疗药是近年来发展快速的药物，特定基因型的患者对免疫治疗会更有效，例如PDL1高表达、微卫星不稳定、高TMB等。从基因检测的循证证据来看，靶向药和免疫治疗药的循证级别最高，意义是更明确的，而化疗药物敏感性的基因，证据等级相对差一些，主要是预测比较严重的毒副作用，避免化疗引起的严重毒副作用。