美文网首页
DNA甲基化

DNA甲基化

作者: 一路向前_莫问前程_前程似锦 | 来源:发表于2021-02-03 11:13 被阅读0次

差异的甲基化

差异的甲基化位点位于基因的prometer区域,我们才去保留,主要包括(TSS200和TSS1500)

注释文件来自ChAMP工具包,data一下即可

一般的差异定义标准为


image.png

参考文献:Immune Signature-Based Subtypes of Cervical Squamous Cell Carcinoma Tightly Associated with
Human Papillomavirus Type 16 Expression, Molecular Features, and Clinical Outcome

差异标准提高:

image.png

参考文献:Epigenetic age acceleration of cervical squamous cell carcinoma converged to human papillomavirus 16/18 expression, immunoactivation, and favourable prognosis

promoter regions 默认(TSS200和TSS1500)

image.png
image.png

参考文献:The signature of HBV-related liver disease in peripheral blood mononuclear cell DNA methylation

image.png image.png image.png

相关文章

网友评论

      本文标题:DNA甲基化

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/vguptltx.html