【小工具教程】识别结合位点

作者: 殷赋科技 | 来源:发表于2020-10-12 10:19 被阅读0次

用途

采用GHECOM等算法识别蛋白质/核酸中潜在的小分子结合位点，输出文件可用于分子对接定义口袋。

入口

功能入口：左侧菜单栏【计算方案】->【小工具】->【分子结构】->【识别结合位点】

1.上传受体文件，点击【检测位点】

上传处理好的蛋白质/核酸受体结构文件，可参考【处理PDB结构】。

2.浏览位点分布情况

表格上方的标签为算法名称，表中给出了各位点编号和对应的容积。点击某一行，右侧视图即实时显示位点（用一堆小球展示）的位置。

a.通常来说，容积较大的位点更有可能真正的位点。将受体的表现形式改为surface，可更直观展示位点所在的空腔形状。

b.后期会继续增加位点识别算法，通过比较多个算法的位点，提高预测准确度。

3.选择位点，点击【下载文件】

该文件可直接用于分子对接定义口袋。

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本文标题：【小工具教程】识别结合位点

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