1991 年日本将水稻基因组制图列入研究规划。
继“人类基因组计划”、“拟南芥基因组计划”提出之后,我国于 1990年开始研讨水稻基因组测序,并于 1992 年正式宣布开展水稻基因组测序,同时在上海成立了中国科学院国家基因研究中心。
1996年,中国在国际上率先完成了水稻 ( 籼稻 ) 基因组物理图的构建,为水稻基因组测序提供了材料基础。
1998 年 2 月,国际水稻基因组测序计划(IRGSP) 正式启动,主要内容是开展水稻遗传图和物理图的绘制,完成基因组序列的测定及基因序列的注释分析等工作。IRGSP 确定以主要栽培品种——粳稻“日本晴”作为测序对象,基于基因组物理图谱进行测序。水稻12 条染色体的测序工作分别由日本 (6 条 )、美国 (3条 )、中国 (1 条 )、中国台湾 (1 条 )、法国 (1 条 )承担,其中印度、韩国、巴西等参与了部分染色体的测序工作。中国科学院上海生命科学研究院国家基因研究中心作为中国大陆的参加单位,承担第 4号染色体的测序工作。
1998 年 2 月,国际水稻基因组测序计划(IRGSP) 正式启动,主要内容是开展水稻遗传图和物理图的绘制,完成基因组序列的测定及基因序列的注释分析等工作。IRGSP 确定以主要栽培品种——粳稻“日本晴”作为测序对象,基于基因组物理图谱进行测序。水稻12 条染色体的测序工作分别由日本 (6 条 )、美国 (3条 )、中国 (1 条 )、中国台湾 (1 条 )、法国 (1 条 )承担,其中印度、韩国、巴西等参与了部分染色体的测序工作。中国科学院上海生命科学研究院国家基因研究中心作为中国大陆的参加单位,承担第 4号染色体的测序工作。
1998 年 2 月,国际水稻基因组测序计划(IRGSP) 正式启动,主要内容是开展水稻遗传图和物理图的绘制,完成基
因组序列的测定及基因序列的注释分析等工作。IRGSP 确定以主要栽培品种——粳稻“日本晴”作为测序对象,基于基因组物理图谱进行测序。水稻12 条染色体的测序工作分别由日本 (6 条 )、美国 (3条 )、中国 (1 条 )、中国台湾 (1 条 )、法国 (1 条 )承担,其中印度、韩国、巴西等参与了部分染色体的测序工作。中国科学院上海生命科学研究院国家
基因研究中心作为中国大陆的参加单位,承担第 4号染色体的测序工作。
2011年9月,中国农业科学院、国际水稻研究所和华大基因共同启动“全球3000份水稻核心种质资源重测序计划”( 3K Rice Genome Project),拉开了水稻核心种质资源全基因组测序和基因组分析的序幕。
2014年5月,3000份水稻基因组测序数据于“世界饥饿日”公开发布于NCBI、DDBJ、GigaScience、阿里云等数据库,与全球共享。同时,基于测序结果建立了若干重要数据库和资源:SNP和表型数据库(Rice SNP-Seek Database);3K 泛基因组数据库(RPAN: Rice Pan-genome Browser);另外,泛基因组和结构变异原始数据将发布在Nature旗下的Scientific Data杂志上。同时,该项目从国际水稻研究所引进了2400份水稻核心种质,极大丰富了我国的水稻遗传多样性。目前3000份水稻种质已经发放给中国科学院、武汉大学、华中农业大学等40家科研单位、高校和育种单位,发放超过4万份次,用于大规模发掘影响水稻高产、抗病虫、抗逆、优质新基因和育种应用,全面开始推进水稻全基因组分子育种。
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