lncRNA数据库

LNCipedia数据库

https://lncipedia.org/只是人的lncRNA综合数据库

starBase数据库

http://starbase.sysu.edu.cn/

目前我认为是最综合的数据库，包括人，鼠的RNA，miRNA，lncRNA，circRNA的综合数据库，其中的miRNA靶基因均是经试验验证过的，不同于targetScan

targetScan数据库

http://www.targetscan.org/vert_72/

对miRNA靶基因进行预测的数据库，还有一个是miRWalk,

miTarBase数据库

http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php

对miRNA靶基因进行预测的数据库

TANRIC数据库

https://ibl.mdanderson.org/tanric/_design/basic/index.html

是lncRNA研究的利器，是癌症非编码RNA的地图集，包括20种癌症，超过8000个样品（用户体验不太好，可能是由于自己网速太差了的原因）。

LncRNAdb数据库

http://www.lncrnadb.org/

包含了有关RNA的参考信息，包括序列、结构信息、基因组背景、表达、亚细胞定位、保守性、功能证据和其他相关信息

GENCODE数据库

https://www.gencodegenes.org/

主要是注释信息gtf文件，包括人和小鼠的转录本

参考文章：

https://cloud.tencent.com/developer/news/386861

http://www.360doc.com/content/18/0515/20/50540690_754224549.shtml

作者：dming1024

链接：https://www.jianshu.com/p/8cf8a14f7e5c

来源：简书

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