1.以转录因子的靶基因预测为例,除了 JASPAR 还 有一个叫 TRANSFAC 的数据库,采用了另一种策略来做预测:集合了大量的 CHIP-seq 实 验结果。什么是 CHIP-seq 呢?染色质免疫共沉淀 16 策讲过,如果把 CHIP 实验中通过抗 体拉下来的转录因子-DNA 复合物,解离所有的 DNA 片段送去测序分析,就知道了一个转 录因子结合的所有 DNA 序列,那就是 CHIP-seq,seq 就是 sequencing 测序的意思。
1.以转录因子的靶基因预测为例,除了 JASPAR 还 有一个叫 TRANSFAC 的数据库,采用了另一种策略来做预测:集合了大量的 CHIP-seq 实 验结果。什么是 CHIP-seq 呢?染色质免疫共沉淀 16 策讲过,如果把 CHIP 实验中通过抗 体拉下来的转录因子-DNA 复合物,解离所有的 DNA 片段送去测序分析,就知道了一个转 录因子结合的所有 DNA 序列,那就是 CHIP-seq,seq 就是 sequencing 测序的意思。
本文标题:2019-05-05
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