美文网首页
2022-05-14单个基因生物信息学分析

2022-05-14单个基因生物信息学分析

作者: 伱茠陌生人 | 来源:发表于2022-05-16 15:30 被阅读0次

以IRX15A为例

Gene Finding in Eukaryota (softberry.com)     1 预测网站

蛋白二级三级结构预测

PSIPRED Workbench (ucl.ac.uk)      二级

SWISS-MODEL Interactive Workspace (expasy.org)    三级结构预测

Services- DTU Health Tech   跨膜结构分析网站

SignalP - 5.0 - Services - DTU Health Tech   信号肽分析    IRX15A的N端没有信号肽

PlantCARE, a database of plant promoters and their cis-acting regulatory elements (ugent.be) 启动子分析

motif分析预测数据库                  用MEME-CHIP预测转录因子的结合

用MEME-CHIP预测转录因子的结合 - 简书 (jianshu.com)

最全miRNA数据库 - 知乎 (zhihu.com)

miRNA的靶点预测    psRNATarget: A Plant Small RNA Target Analysis Server (2017 Update) (zhaolab.org)还是可以用

我输入的文件是IRX15A3UTR片段,找到zma-miR529-5p,靶点为

RNA:UUCUUCUACUUUUUUUUUUCU

DNA:TTCTTCTACTTTTTTTTTTCT

基因结构预测          Gene Finding in Eukaryota (softberry.com)

mRNA的二级结构预测RNAfold web server (univie.ac.at)

IRX15A

引自:单个基因生物信息学分析_哔哩哔哩_bilibili

最全miRNA数据库 - 知乎 (zhihu.com)

相关文章

网友评论

      本文标题:2022-05-14单个基因生物信息学分析

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/voymurtx.html