积累

基于单核苷酸多态性的食品中大肠埃希氏菌溯源技术

目前，食品安全问题已成为我国继人口、资源、环境之后的第四大社会问题。在所有食品安全问题中，由致病菌或条件致病菌的污染引起的食品安全事件又占有相当大的比重。在这些致病菌中由致病性大肠埃希氏菌引起的食品安全问题尤其值得人们关注。从肆虐全球30年可引起腹泻、出血性肠炎等疾病的大肠埃希氏菌O157︰H7到近期出现在德国的大肠埃希氏菌O104︰H4疫情，所有这些由致病性大肠埃希氏菌引发的公共卫生事件造成了严重的人员及财产损失并引发了全球的高度关注。 因此，建立一种可以对不同地理来源的大肠埃希氏菌进行有效追溯的方法将对于控制食源性感染、追溯食品中致病性大肠埃希氏菌来源将起到重要作用。目前，大肠埃希氏菌溯源研究主要集中在寄主溯源，并且多种分子生物学技术运用于该领域的研究中。与其他分子溯源技术相比，MLST技术以其流程标准化，结果易于验证，重复性好，数据便于通过互联网共享等特点在多种细菌来源追溯研究中被广泛使用。但是MLST技术依靠大量基因测序，不适用于大量样本的溯源检测。 而SNP检测技术使用简单、便捷、低成本的方法就可以获得可靠结果。因此，基于大肠埃希氏菌持家基因SNP溯源分析技术逐渐成为新兴热点。但是SNP技术在大肠埃希氏菌地理来源追溯方面的研究仍是空白。 本研究首次将SNP技术应用于大肠埃希氏菌的地理溯源研究。 本研究简述如下： 1.大肠埃希氏菌持家基因的选择。根据文献报道结合自行软件计算基因多态性值，选择大肠埃希氏菌四个持家基因clpX（caseinolytic peptidase X，酪蛋白水解蛋白酶X），fadD（acyl-CoA synthetase，酰基辅酶A合成酶)，mdh(苹果酸脱氢酶),uidA(beta-glucuronidase，葡萄糖苷酸酶)作为研究的目标基因。 2.持家基因中多态性位点的筛选。以大肠埃希氏菌多位点序列分型数据库（MLST Database)数据为基础，采用生物学软件Minimum SNPs计算四个持家基因中能够反映位点分辨力的辛普森系数（即D值）、选择D值大于0.86并结合文献报道及人工序列比对选择候选位点。共获得12个SNP位点。 3.不同地理来源大肠埃希氏菌菌株收集。从进口生畜肉及加工食品及食品原料中分离大肠埃希氏菌菌株。生畜肉来自四大洲，12个国家和地区：欧洲的丹麦（63株），德国（20株），爱尔兰（17株），法国（17株），西

昨天晚上10点20睡觉，可是今早4点10分就醒了，无聊之际看看文章摘要

这篇文章需要提取一些信息，我现在很困，再睡会儿吧。

大肠埃希氏菌四个持家基因clpX（caseinolytic peptidase X，酪蛋白水解蛋白酶X），

fadD（acyl-CoA synthetase，酰基辅酶A合成酶)，

mdh(苹果酸脱氢酶),

uidA(beta-glucuronidase，葡萄糖苷酸酶)

今天收拾实验室桌子，扫地，拖地

说真的，为什么要执着于这样的小务，而不去思考执行大务。虽然我还是会坚持抽一点时间完成这些小务，但我更想思考如何建立一个完备而简捷的办法把所做过的事情全部记录下来。

不管怎样，记得十点半之前睡觉。