写在前面
最近在做一些数据分析工作，发现需要用到以前我参与发表论文里面的一颗物种树。
然而，一时找不到这棵树的 newick 文本，于是画不了....咋整？
用 TBtools 的老功能
事实上，估计是五年前，TBtools 就有这个功能，叫「Plant PhyloTree Rebuild from Dual Name」，大体意思是基于物种双名直接获取物种树（事实上是基于 APG IV 和相关一些演化关系）。
使用起来非常简单，直接在 TBtools 的 Cowtransfer 仓库下载 「TBtools.PhyloTreeBackEnd」文件（或点击 Prepare DB然后等待一段很长的制备时间），随后填入所有想要获得物种演化关系的科学双名。
这里用到一个trick，也就是「打开微信」，直接截图文献，发送给你某个微信好友
然后点开图片，会发现文本被自动识别了，ctrl+c/v，随后手动调整一下换行，基本就没问题了
随后直接放进去物种双名列表
然后，点击 Start 开始
搞定，这个物种数就可以用于后续分析或者可视化了
写在最后
小时候写的功能，感觉还是挺实用的
网友评论