内容:摘要
榕树的一大特点是它拥有非凡的气生根。榕属的一些物种与黄蜂传粉者进化出一种物种特有的互惠共生系统。本研究对中国榕树和一个缺乏气生根的物种对叶榕,和一个与榕树共进化的黄蜂基因组进行了测序。对两种榕树的基因组进行比较分析,发现了与适应性进化相关的动态核型变异。生长素相关基因复制数量的增加和生长素产量的提高与榕树气生根的发育有关。一个雄性专一的无性繁殖的平行基因FhAG2被确定为对叶榕性别决定的候选基因。榕树群体基因组分析,揭示了其与传粉者的形态和生理共适应的基因组特征,包括萜类和苯类衍生化合物。这三种基因组为研究气生根、雌雄同株和共生系统的起源提供了思路和基因组资源。
背景介绍
1 介绍研究的对象:榕树是热带和亚热带植物,以其气生根众多和作为景观植物而出名。榕属是比较古老的属,距今7500万年历史。榕属的植物分布极其广泛,可见其适应很广。
2 研究的重要意义:无花果是最早驯化的作物之一,也是佛教和印度教等宗教中反复出现的主题。无花果和它们的专一传粉蜂物种是研究生态学和进化基本现象的模型系统,包括合作、共同进化、生态网络、共同多样化和对气候变化的响应。本研究选用了2种榕属物种,分别代表了雌雄同株和雌雄异株两种不同的生殖类型,代表了半附生和地生型两种不同的生长类型。而且榕属植物作为研究植物-昆虫相互作用的理想模型系统也具有重要意义。
3 因此,本研究通过解析其高质量基因组,将帮助我们揭示这个大属这些特征背后的遗传机制,包括气生根发育、性别决定、该属的起源和进化,以及榕属物种与黄蜂传粉者的共同进化。
感悟
一直都听说测全基因组很贵,但很好奇,如今测一个植物全基因组的价格大概是多少,测算依据是啥?想看看我们这样的小课题组有没有机会。
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