美文网首页
数据挖掘0308

数据挖掘0308

作者: 五官端正123 | 来源:发表于2021-03-08 23:24 被阅读0次

    所有资料来源于生信技能树

    1. 常用的可视化R包

    image.png

    (1)Base

    image.png
    image.png

    高级函数是出图,低级函数是添砖加瓦

    2.ggplot2语法

    image.png

    入门级模板

    ggplot(data = <DATA>) + <GEOM_FUNCTION>(mapping = aes(<MAPPINGS>))

    2.1属性设置

    image.png
    geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy), color = "blue")
    ggplot(data = mpg) + 
    geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy), 
    size = 5, # 点的大小5mm
    alpha = 0.5, # 透明度 50%
    shape = "※") # 点的形状
    
    image.png

    2.2映射

    image.png 颜色设置方法
    image.png 自行指定映射的颜色
    R语言颜色

    搜索16禁止颜色代码,替代下图中的红框

    image.png image.png
    color是边框颜色,fill是内心颜色

    2.3分面

    image.png 双分面

    2.4几何对象

    image.png image.png
    image.png

    当全局变量和局部变量冲突时,以局部变量为主!!!

    ggplot(test,aes(x = Sepal.Length,
                    y = Petal.Length,
                    color = Species)) +"#color属于全局变量"
      geom_point()+
      geom_smooth(color = "black")"#color属于局部变量"
    
    image.png
    ggplot(test,aes(x = Sepal.Length,
                    y = Petal.Length,
                    color = Species)) +"#color为全局变量"
      geom_point()+
      geom_smooth()"#作为局部变量的color已经删除"
    
    image.png

    2.5几何对象

    image.png
    View(diamonds)
    table(diamonds$cut)
    
    ggplot(data = diamonds) + 
      geom_bar(mapping = aes(x = cut))
    
    ggplot(data = diamonds) + 
      stat_count(mapping = aes(x = cut))
    
    image.png
    ggplot(data = fre) + geom_bar(mapping = aes(x = Var1, y = Freq), stat = "identity")
    image.png
    ggplot(data = diamonds) + geom_bar(mapping = aes(x = cut, y = ..prop.., group = 1))

    y=..prop..

    image.png

    2.6位置关系

    (1)

    2.7坐标系

    image.png
    完成的绘图模板
    ggplot(data = x, mapping = aes(x = Sepal.Width, y = Species,
                                   ),  
           ) + 
      geom_violin(aes(fill=Species))+
      geom_boxplot() +
      geom_jitter(aes(shape=Species))
    
    image.png

    3.ggpubr语法

    4.图片的保存和导出

    4.1ggsave

    image.png

    4.2eoffice

    image.png

    相关文章

      网友评论

          本文标题:数据挖掘0308

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/vurmqltx.html