第二天

作者: 小胖_81fb | 来源:发表于2019-07-25 13:15 被阅读0次

    20190725

    今天学习 官网的细胞周期的得分与回归

    Cell-Cycle Scoring and Regression

    原网站https://satijalab.org/seurat/v3.0/cell_cycle_vignette.html

    文中写道需要下载新的一个文件,对此文件进行seurat的对象进行处理。

    并且我发现很多时候做分析都说了不能影响下游分析

    Assign Cell-Cycle Scores

    在细胞周期分配得分时,采用的方法是:使用了G2M和S阶段的定量评分

    而并没采用离散分法

    可是花细胞周期分布的时候,要注明是哪个细胞的(具体就要看个人的生物医学背景了)

    对于细胞之间的异质性,在版本1.4是单独的一个函数,现在合并到lScaleData这个函数中

    在每次做PCA时会根据需求调整features这个参数

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