miRNA数据库简介及miRNA靶基因批量预测

前面给零星的给大家介绍过一些miRNA相关的数据库，包括

1. miRBase数据库介绍及miRNA数据下载

2.miRBase物种名缩写

3.miRNA 靶向预测软件targetscan

4.RNA相互作用神器——ENCORI

也给大家介绍过一些miRNA数据处理相关的内容

1.如何获取人的所有miRNA ID

2.三种方法提取miRNA成熟体序列

3.R下载合并ENCORI miRNA靶基因数据

还给大家介绍过如何基于ENCORI数据库和Targetscan数据库里面的数据，利用R来批量预测miRNA的靶基因，包括miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA以及miRNA-circRNA之间的调控关系。

1.R批量预测miRNA和靶基因之间的调控关系-ENCORI篇

2.R批量预测miRNA和靶基因之间的调控关系-TargetScan篇

可能有些小伙伴会觉得公众号里面的内容比较分散，不够系统。虽然批量预测的代码，我写了很详细的注释，可能还是有些小伙伴觉得理解起来有些费劲。所以我特地将miRNA相关数据介绍和miRNA靶基因批量预测整理成了一个☞线上课程。除了前面已经讲解过的miRBase，ENCORI和targetscan这几个数据库，我还增加了另外一些常用的数据库，如mirTarBase，miRcode。对ENCORI和targetscan这两个数据也进行了更深入和细致的讲解。

对于R批量预测miRNA靶基因的代码，也利用视频进行了详细的讲解，方便大家理解。课程的详细信息如下

这门课程一共包含13节课程，
1.第一节，介绍miRBase数据库，以及如何从miRBase数据库下载miRNA数据
2.第二节，介绍miRTarBase数据库
3.第三节，介绍miRcode数据库
4.第四节，介绍starbase(ENCORI)数据库，以及利用starbase预测miRNA-mRNA之间调控关系
5.第五节，利用starbase预测miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA之间调控关系，以及其他RNA-RNA之间相互调控关系，还有ceRNA网络鉴定。
6.第六节，介绍starbase的pancancer功能，如何画基因表达箱型图，生存曲线以及表达相关性散点图
7.第七节，基于starbase所有的预测结果(已经帮大家下载好了人和鼠的所有预测结果，可以直接使用)，利用R代码批量预测miRNA-mRNA之间的调控关系
8.第八节，基于starbase所有的预测结果(已经帮大家下载好了人和鼠的所有预测结果，可以直接使用)，利用R代码批量预测miRNA-lncRNA，miRNA-circRNA之间的调控关系
9.第九节，介绍Targetscan数据库，如何查找miRNA的靶基因以及通过靶基因查找调控的miRNA
10.第十节，下载Targetscan预测结果以及注释文件
11.第十一节，基于Targetscan所有的预测结果，利用R代码批量预测miRNA-mRNA之间的调控关系
12.第十二节，windows下如何安装R和Rstudio软件
13.第十三节，mac下如何安装R和Rstudio软件

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