今天安装了conda，走了好多弯路心情极度暴躁（之前都是直接用的别人下的软件，但因为这次要下软件的他们没下过，又听说用conda很方便，所以就想学习通过conda下一个）
下载背景：其实集群里我的.bashrc文件里已经有一个conda路径了（应该师兄下的）：which conda是能找到的，但是不知道为啥用那个conda进行 conda install ...的时候总是报错，就干脆自己下一个了，也是学习的过程，这里下的是miniconda3
第一步：
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
（下载网址是：https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html，网址最下面有Linux installers，选择Miniconda3 Linux 64-bit，再右键复制链接地址，这个链接地址就是https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh了）
第二步：
下载好sh文件后，运行： bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
运行过程中的问题选择yes就行。关于运行过程中出现的一个要不要初始化的问题，有看到网上有人说选择no比较好，以免与已有的软件不兼容，这里可以自己选择，因为我不太清楚哈哈，不过不管选择yes还是no好像都能完成安装。（我选择的是yes）
这里下载后应该是默认安装在home目录下： ~/your_name/miniconda3
第三步：
环境变量的配置（听同学说，她下载好后，.bashrc文件里直接有关于conda的内容了，但是可能是因为我的环境变量里本来就有conda了（下载背景里提到的），所以我这里..反正是没有自动出现在我的.bashrc文件里，于是在自己下载了miniconda后，又自己手动再配置了一遍——把原来的全部注释掉，地址换成自己的地址）。.
①vim ~/.bashrc #编辑.bashrc 文件
②bashrc文件里关于conda的部分如下：
# <<< conda initialize <<
__conda_setup="$('/conda安装的地址/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
if [ $? -eq 0 ]; then
eval "$__conda_setup"
else
if [ -f "/conda安装的地址/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
. "/conda安装的地址/etc/profile.d/conda.sh"
else
export PATH="conda安装的地址/bin:$PATH"
fi
fi
unset __conda_setup
# <<< conda initialize <<
第四步：
source ~/.bashrc
第五步：
利用conda下载软件：conda install -c bioconda 软件名 （虽然下的是miniconda3，但是命令里用的还是conda哦）
也可以通过如下方式获得安装命令（图片上传失败了嘤嘤嘤）：在https://anaconda.org/ 里搜索你要下载的软件名——点击你要下载的那一个软件（搜索后会出来不同版本、名字相近的软件）——点击进入后，下拉页面，会有用conda下载该软件可用的命令，如conda install -c bioconda samtools 和 conda install -c bioconda/label/cf201901 samtools
到这里conda就安装好并且可以利用conda来下载软件了，遇到的问题：
1、原本在集群的节点1下载安装的，总是报错，后来换了节点2就可以了（同学说是节点2才联网，这里我还真不太清楚，关于不同的节点，可能还要再学习下到底是什么意思，之前只是死板的用ssh跳转就完事了）
2、最开始按照的网上的下载教程，安装完conda好、利用conda下载别的软件前，还要创建虚拟环境，但是我在这个过程中疯狂报错：CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url 。参考了网上很多的解决方法：
① https://blog.csdn.net/Copper01/article/details/97134974?utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-BlogCommendFromMachineLearnPai2-1.baidujs&dist_request_id=1328707.489.16166807356501553&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant.none-task-blog-BlogCommendFromMachineLearnPai2-1.baidujs （解决Anaconda出现CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url问题）
② https://blog.csdn.net/qq_29861217/article/details/94051055（关于使用anaconda出现CondaHTTPError问题的解决）
③https://www.jianshu.com/p/429a9a1c3613 （miniconda安装软件流程）
为了解决报错，我采取了包括加入清华镜像源、删除 ~/.condarc文件中的defult一行、把.condarc文件中的https改成http等等，都没能解决报错。
问同学他们之前是怎么操作的，说是根本没有创建conda环境，于是我把我的 .condarc 文件清空、再conda deactivate 退出（表现为命令行前段不显示（base））、然后直接conda install -c bioconda 软件名，就成功了（这里要是在上述的节点2下载软件才行）。这是为什么我还是不明白，如果有大神能帮忙解答疑惑，非常感谢！
3、关于conda的激活和添加镜像，上面链接③里讲的挺详细的（虽然我没用到，但是基于我在这上面疯狂报错还浪费了不少时间，还是把相关知识点记录一下吧），简而言之：
1）conda激活：source ~/miniconda3/bin/activate （或者conda activate）
2）conda添加国内镜像：conda config --add channels 网址（详见上方链接，我也不知道这个网址哪里来的，清华镜像源），使用了conda config命令后，会自动在home目录下生成.condarc文件，里面会有我们添加的镜像信息
3）创建虚拟环境：conda create -n name1 python=3.8
或者conda create --name name1 python=3.8
(python版本应该是可以通过 conda list 命令查看，网上看到说不用python= 也行，说是不写就是用默认安装的python；name1是你为创建的虚拟环境起的一个名)
4）进入环境：source activate name1
5）可以利用conda下载软件了
仅以此文，记录下今天的conda下载~
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