剔除所有含有N碱基的序列
from Bio import SeqIO
no_N_records = [record for record in SeqIO.parse('test.fa','fasta') if 'N' not in record.seq]
SeqIO.write(no_N_records, 'out.fa','fasta')
剔除全是N碱基的序列
from Bio import SeqIO
not_only_N_records = [record for record in SeqIO.parse('test.fa','fasta') if ''.join(set(record.seq))!='N']
SeqIO.write(not_only_N_records, 'out.fa','fasta')
剔除所有含有N碱基的序列 剔除全是N碱基的序列
any()实现了或(OR)运算，而all()实现了与(AND)运算
归并排序 归并排序采用分治的思想： Divide: 将n个元素平均划分为各含n/2个元素的子序列。 Conquer...
排序概念 排序：将一个数据元素（或记录）的任意序列，重新排列成一个按关键字有序的序列。 排序定义 假设含n个记录的...
前言： 一般测序下机数据会存在含N比例过大、测序质量较低的碱基数占比过高、含有duplication、序列污染等低...
Easy 序列含有n个元素，返回往右旋转k步的序列 For example若n = 7, k = 3,序列 [1,...
Easy Count-and-say 序列是一个如下的整数序列。 给定一个整数n，返回第n个序列。序列用strin...
给出一个包含 0 .. N 中 N 个数的序列，找出0 .. N 中没有出现在序列中的那个数。 missing-n...
基本思想 将初始序列(A[0] ~ A[n-1])作为待排序序列，第一趟在待排序序列(A[0] ~ A[n-1])...
题目 给出一个包含 0 .. N 中 N 个数的序列，找出0 .. N 中没有出现在序列中的那个数。 样例N = ...
本文标题：[Py014] 剔除含N序列
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/wcejtqtx.html
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