grep

作者: MLD_TRNA | 来源:发表于2021-05-22 20:53 被阅读0次

参考:http://man.linuxde.net/grep

1.grep命令

(1)查找genome.txt中的RNA有多少个

</article>

grep RNA genome.txt |wc

(2)打印出genome.txt中以#开头的行

grep '^#' genome.txt 

(3)不打印出genome.txt中以#开头的行

grep -v '^#' genome.txt 

(4)精确查找并计数

grep -w SRR2345 genome.txt |wc

(5)提取特定字符串前后多少行(字符串所在行算作一行)

 grep -A|B n "key" file
#A和B可以分别出现-A 10 | -B 10
A:表示在字符串之后 after  context
B:表示在字符串之前 before context
n:要获取多少行文本 line number
key:为要查找的字符串
file:文件名

例如

grep -A 2 "id" go-basic.obo
图片.png

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