美文网首页
在线作图|如何绘制一张星图

在线作图|如何绘制一张星图

作者: 维凡生物 | 来源:发表于2021-08-25 08:54 被阅读0次

    物种丰度星图

    星图是展现物种丰度的统计图之一,它与饼图类似,每块扇形面积大小代表物种丰度的大小,但不同的是,星图每块扇形区域的长度(半径)与该物种的丰度有关,宽度是相等的,而与常规饼图扇形的宽度才是重要的,半径大小意义不大。

    image

    如何不使用R语言绘制物种丰度星图?

    云图图网站可以画!(www.cloudtutu.com,免费的哦~)
    操作步骤如下:
    ①登录网址:www.cloudtutu.com(推荐使用360或者谷歌浏览器)
    ②输入用户名和密码(已经为大家填好了),输入验证码后即可登录;
    ③登录后在全部工具那一栏找到物种丰度星图,点击进入;
    ④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作~

    Step 01 上传文件

    ※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别)
    a)准备一个数据矩阵(形式参照示例数据,如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表,也可以是测量数据,例如身高、体重、表型等);
    b)表格需要带表头和列名,每一列为样本名,每一行为各种指标数据名,例如OTU、基因ID、身高、代谢物名称等;
    c)请提交txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后点击“上传”按钮上传该文件。

    image

    Step 02 参数设置

    2.1 物种数量:元素数量多少,剩余元素会合并成others展示
    2.2 标签大小:图例标签文字大小,不宜设置过大


    image

    Step 03 下载文件

    点击“运行”开始作图,点击“下载”保存PDF格式的矢量图。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。

    Step 04 作图后处理

    TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。

    Step 05 写作建议

    XXXX was performed on Tutools platform (https://www.cloudtutu.com), a free online data analysis website.

    相关文章

      网友评论

          本文标题:在线作图|如何绘制一张星图

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/whgkiltx.html