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概率软逻辑(PSL,Probabilistic soft log

概率软逻辑(PSL,Probabilistic soft log

作者: 张嘉嘉呵呵哒 | 来源:发表于2018-08-14 23:04 被阅读0次

    一、简介

    概率软逻辑(PSL,Probabilistic soft logic)是用于开发概率模型的机器学习框架,由加州大学圣克鲁兹分校和马里兰大学的统计关系学习小组LINQS开发。目前其复杂的环境构建方式和Groovy语言表达给像作者一样的初学者带来了不小的困难,而且诸多的依赖项经常使原本已经构建好的模型小错误频繁。

    经过努力,作者将其构建成单个jar包,并且加入编码机制使其可以支持各种语言的数据。主要贡献有三:

    1.将PSL原本复杂的依赖打包为单个jar包,加入依赖即可开始使用。

    2. 将不够熟悉的Groovy语言模型构建方式全部转化为.java支持,只需一个.java文件便可进行模型构建。

    3.加入编码机制,使PSL可以轻松处理除英文以外语言的数据。

    链接:https://pan.baidu.com/s/1PybpNoPpvk4jmSMw7Rm_7A 密码:g1cx
    链接文件夹里有三个文件:
    PSL_swust1.0.jar 修改过的PSL模型
    SimpleAcquaintances.zip PSL官方例子的改编版本(不包含权重学习和函数)
    Entity_resolution.zip PSL官方例子的改编版本(包含权重学习和函数)

    使用时请将PSL_swust1.0.jar加入java项目依赖即可,导入示例项目也需要将项目lib文件夹下PSL_swust.jar加入依赖。

    二、举例说明

    以SimpleAcquaintances内SimpleAcquaintances.java为例进行阐述。

    1.配置项

    /*
             * ======【配置项】======
             */
            Tool tool = new Tool();
            DataStore datastore;
            HashMap<String, Partition> partitions = new HashMap<String, Partition>();
            String path = tool.getPath(new SimpleAcquaintances().getClass())
                    + "/../data/";// SimpleAcquaintances改为当前类名
            String[] paths = tool.getFiles(path);
            PSLMODEL psl = new PSLMODEL(paths, "H2");// 在安装了postgresql数据库时可H2改为postgresql
            datastore = psl.getDatastore();
            psl.transcoding = false;//是否给数据编码(此值只决定数据是否编码,谓词默认都要编码)
    

    • 使用时SimpleAcquaintances需要改为当前类名(目的是为了通过Tool类 getPath() 函数获取获取当前项目文件夹)。
    • 当安装配置了postgreSQL时可将 “H2” 改为 “postgresql” 来使用postgreSQL数据库(H2为模型自带数据库,运行于内存)。
    transcoding 项设置为 true 时候模型会给数据编码,此时模型可以支持处理各种语言的数据(另外,设置true编码后设置谓词属性为UniqueIntID,可提升模型计算效率)。
    • 此修改后的版本依然保留了PSL自带的相似度计算函数和自定义函数功能,但是编码后的数据无法通过PSL自带相似度计算函数计算相似度 (因为,编码后的数据不再是原来的字符串)。

    2.定义分区

            // 权重学习分区
            // partitions.put("learn_obs", datastore.getPartition("learn_obs"));
            // partitions.put("learn_target",
            // datastore.getPartition("learn_target"));
            // partitions.put("learn_truth", datastore.getPartition("learn_truth"));
            // 实验分区
            datastore = psl.getDatastore();
            partitions.put("obs", datastore.getPartition("obs"));
            partitions.put("target", datastore.getPartition("target"));
            partitions.put("truth", datastore.getPartition("truth"));
            psl.setPartitions(partitions);
    

    当需要权重学习时(有训练数据时),需要定义权重学习分区。
    • “obs” 代表已知数据分区;
    • “target” 代表要推理的目标数据储存分区(当要使用LazyInference推理时可以不往里面加载数据),
    • “truth” 为真实数据分区。

    3.谓词(函数)定义

    HashMap<String, ConstantType[]> p = new HashMap<String, ConstantType[]>();
            HashMap<String, ExternalFunction> f = new HashMap<String, ExternalFunction>();
            // 添加谓词
            p.put("Lived", new ConstantType[] { ConstantType.UniqueStringID,ConstantType.UniqueStringID });
            p.put("Likes", new ConstantType[] { ConstantType.UniqueStringID,ConstantType.UniqueStringID });
            p.put("Knows", new ConstantType[] { ConstantType.UniqueStringID,ConstantType.UniqueStringID });
            // 添加函数
    //      f.put("SameInitials", new SameInitials());
    //      f.put("SameNumTokens", new SameNumTokens());
            psl.definePredicates(p, f);// 谓词、函数输入模型
    

    • 谓词定义只需替换修改即可,可随意增减。
    • 谓词常用属性有UniqueStringID、UniqueIntID、String等。
    • 函数可以定义PSL自带相似度函数(transcoding 为false时),也可定义继承ExternalFunction的自定义函数。

    4.规则定义

    String[] rules = {
    
                    "20.0: ( LIVED(P1, L) & (P1 != P2) & LIVED(P2, L) ) >> KNOWS(P1, P2) ^2",
                    "5.0: ( (L1 != L2) & (P1 != P2) & LIVED(P2, L2) & LIVED(P1, L1) ) >> ~( KNOWS(P1, P2) ) ^2",
                    "10.0: ( LIKES(P2, L) & (P1 != P2) & LIKES(P1, L) ) >> KNOWS(P1, P2) ^2",
                    "5.0: ( KNOWS(P1, P2) & KNOWS(P2, P3) & (P1 != P3) ) >> KNOWS(P1, P3) ^2",
                    "1.0 * KNOWS(P1, P2) + -1.0 * KNOWS(P2, P1) = 0.0 .",
                    "5.0: ~( KNOWS(P1, P2) ) ^2"
    
            };
            psl.defineRules(rules);// 规则输入模型
    

    规则格式: 权重: 规则体 >> 规则头
    • ^2代表平方优化,
    • 定义自己项目的规则只需按照例子里的规则格式增减规则即可。
    提示:算术规则的定义只能写成 "apredicateX(A,B)+bpredicte(A,B)= 0.0 ." 的形式,如PSL可接受的规则:“Knows(P1, P2) = Knows(P2, P1) .” 在作者修改版本中请写成 "1.0 * KNOWS(P1, P2) + -1.0 * KNOWS(P2, P1) = 0.0 ." ,否则会报错,后期会进行优化。

    5.导入数据

    /*
             * ======【导入数据】======
             * 其中"1-2"表示对数据的一二列进行转码
             * 只有在transcoding = true时作用,表示只对1,2两列进行转码
             */
            psl.loadData("Lived", path + "Lived_obs.txt", "obs", "1-2");
            psl.loadDataTruth("Likes", path + "likes_obs.txt", "obs", "1-2");
            psl.loadData("Knows", path + "knows_obs.txt", "obs", "1-2");
            psl.loadData("Knows", path + "knows_targets.txt", "target","1-2");
            psl.loadDataTruth("Knows", path + "knows_truth.txt", "truth","1-2");
    //      ArrayList<String[]> likepe = tool.fileToArrayList(path + "likes_obs.txt", "1-2-3");
    //      psl.insertDataTruth("Likes", likepe, "obs");
    //      psl.insertData("Likes", likepe, "obs");
    

    • 此版本提供了loadData,loadDataTruth,insertData,insertDataTruth四种方法载入数据,格式为:loadData("谓词",谓词对应数据文件路径, "要导入的分区", "要取的列(不包含概率值那一列)")
    loadData,loadDataTruth中的"1-2"表示对数据的一二列进行转码, 只有在transcoding = true时作用,表示对数据文件里的1,2两列进行转码,多列增加即可,以“-”分开。
    • loadData,loadDataTruth区别在于:用loadDataTruth加载数据,默认最后一列为概率值
    insertData,insertDataTruth适用于一个数据文件存储了多个谓词对应数据的情况,使用前需要先将文件转化为List数据,此文版本里包含的工具类Tool提供了 fileToArrayList("文件路径","要提取的列数")函数辅助完成转化工作。
    • ""1-2-3""表示要取出1、2、3作为谓词的数据,insertDataTruth取出的每个数据 "1-2-...-n"的第n项默认是概率值。

    6.权重学习

    //  psl.learnWeights("learn_target", "Lived-Likes", "learn_obs", "learn_truth","MaxLikelihoodMPE");
    

    格式:learnWeights("训练数据目标分区", "封闭谓词,即:作为已知数据,推理过程不会再新产生的原子", "训练数据已知数据分区", "真实数据存放分区","权重学习方法")
    • 当有训练数据时候可进行权重学习优化规则权重。
    • 此版本保留了五种PSL权重优化方法:
    "LazyMaxLikelihoodMPE",
    "MaxLikelihoodMPE",
    "MaxPiecewisePseudoLikelihood",
    "MaxPseudoLikelihood",
    "SimplexSampler"
    替换即可使用。

    7.打印输出模型

    psl.printModel();
    

    • 可用于查看已经定义的模型及编码后的模型(规则)。

    8.运行推理

    //      psl.runLazyInference("已知数据分区", "目标分区(存放结果)");
    //      psl.runLazyInference("obs", "target");
    //      psl.runInference(""已知数据分区"","封闭谓词1-封闭谓词2" , "目标分区(包含定义的目标原子)");
            psl.runInference("obs","Lived-Likes" , "target");
    

    • 此版本有两种推理方式:LazyMPEInference,MPEInference
    LazympeInference格式:runLazyInference("已知数据分区", "目标分区 用于存放结果")
    MPEInference格式:runInference(""已知数据分区"","封闭谓词1-封闭谓词2" , "目标分区 包含了输入的目标原子")

    9.数据输出

    psl.writeOutput("target", "Knows", path
                    + "/result/knows_inffer.txt");
    

    • 输出函数使用格式:writeOutput("目标分区", "要输出的数据对应谓词1-要输出的数据对应谓词2", 输出路径)

    10.评估实验结果

    psl.evalResults("target", "truth", "Knows", path
                    + "/result/evalResults.txt");
    

    • 评估函数使用格式:evalResults("目标分区", "真实数据分区", "目标谓词1-目标谓词2", 评估结果输出路径)
    • 值得一提的是,"目标谓词1-目标谓词2" 项需要填写所有真实数据分区所包含数据对应的谓词。

    11.关闭模型

    psl.closeModel();
    

    • 推理完成,请关闭模型。

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