生信星球学习小组day3——linux环境下安装软件——Milin我心

今天的学习模式是串联的模式

第一步：先在云服务器上使用uname -a查看是多少位，答案是64位的，在[清华镜像]（https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/）网站上，选择“latest”的linux x86_64的版本下载，下载的命令是wget，注意复制可以从windows系统中鼠标悬浮在目标上点右键可以查看复制待链接。
第二步：安装，安装的命令是bash 文件名，中途yes、enter等等。
第三步：激活， source ~/.bashrc
第四步：添加镜像， conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda conda config --set show_channel_urls yes
第五步：查看conda上所有软件列表，conda list，感觉确实包括很多好软件！
第六步：搜索自己感兴趣的conda软件，conda search 软件名
第七步：安装这个软件，conda install 软件名
第八步：卸载这个软件，conda remove 软件名
第九步：conda环境：首先查看当前环境 conda info --envs，可见目前只有一个环境，即base，然后建立另一个环境，课程中举了rnaseq的例子，用三代python，conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y,再次查看环境后发现又多出了一个 rna-seq 的环境，最后conda activate rna-seq激活环境。
思路导图如下：