2019-05-24

作者: 南山布谷 | 来源:发表于2019-05-24 14:54 被阅读0次

    Windows下升级R3.6及Bioconductor3.9

    查看R版本的方法:打开RStudio可以显示,截图如下:

    R版本查看

    升级R3.6命令:
    安装installr:install.packages("installr") 如果已经安装了就略过这一步
    升级:installr::updateR()
    一路下去就可以了,我是在RStudio中进行的,注意一点就是中间有一布提示是否打开rGUI,这一步点No。
    注意同意把原来的安装包复制到新的版本中。

    升级到Bioconductor3.9

    命令:BiocManager::install(version = "3.9")
    升级完成后会提示升级相关的安装包,点击yes即可。
    查看安装包的位置命令:.libPaths()
    查看Bioconductor3.9版本命令:BiocManager::version()


    备注:一开始用的是官方的命令
    if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
    BiocManager::install()
    提示错误如下:Error: Bioconductor version '3.8' requires R version '3.5'

    升级其他包

    rvcheck::update_all()

    更改R版本

    在RStudio中的tools的global options中,更改后重启RStudio即可。


    更改R版本

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