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生物信息学-张红-第二章-计算机基础

生物信息学-张红-第二章-计算机基础

作者: 耗奇害死猫 | 来源:发表于2018-01-04 11:12 被阅读0次

    第二章 计算机基础

    数据库、数据库的查询指令、计算机网络基础
    

    数据库

    数据管理

    手工管理
    文件系统:
        文件系统的缺陷:
            1.数据间缺乏联系
            2.数据冗余
            3.数据不一致
        索引文件:索引表+链接文件
            索引项由关键字+指针构成
    数据库
        控制功能:
            1.数据完整性
            2.数据安全性
            3.数据库的并发控制
            4.数据库恢复
    手工管理-->文件系统的计算机管理-->数据库系统管理,朝着集成化、网络化、智能化        
    

    数据库基本概念

    数据库DB:统一管理的相关数据的集合
    数据库管理系统DBMS:对db管理的软件
    数据库技术:研究数据库的结构、存储、设计、管理和应用的一门软件学科。
    数据模型:数据库结构和语义的一种抽象描述
    数据模型由 数据库结构、数据操作、完整性约束组成
    

    数据库系统的组成:硬件软件应用程序

    数据库 <--> 数据库管理系统 <--> 用户程序
    

    关系数据库

    关系数据库基于关系数据模型,其典型作用是用非嵌套的表格结构表达实体集和联系集

    结构化查询语言(SQL)的使用
    SQL是集 数据定义元DDL、数据操纵语言DML、数据控制功能 于一体的数据库语言
    SQL的最主要、最核心是**查询功能**。
    可在命令行中交互式使用,也可以在应程序中使用。
    
    查询命令:SELECT
    SELECT [<属性名>] :说明查找什么数据
    FROM <表明列表> :说明数据从那些表中找
    [WHERE <条件表达式>] :查找条件
    通配符
    
    查询命令:
    显示次序: SELECT A,B
    重命名; aliasname=name
    删除重复行:SELECT DISTINCT(ALL表示所有行)
    返回行数: SELECT TOP # (返回#行),SELECT # PERCENT(返回百分比行数)
    
    WHERE 设定查询条件,逻辑判断,比较判断
    
    ORDER BY {column_name [ASC|DESC]} [,...n]
        ASC:升序,DESC:降序
    
    数据库的保护:
    数据库的安全性
    数据库的完整性
    

    计算机网络

    定义:利用通信线路和通信设备,把地理上分散、具有独立功能的多个计算机系统相互连接,按照网络协议进行数据通信,实现资源共享的计算机系统的集合。

    计算机+通信+软件=网络

    网络的功能:信息交换、资源共享、分布式处理

    计算机网络由通信子网资源子网构成

    按照距离分为局域网LAN和广域网WLAN

    局域网由一台或多台服务器和若干工作站组成。
    

    客户机/服务器体系结构:Client/Server:cs架构

    关键在于功能的分布化。
    一些功能从传统的主机放到了客户机上,剩下的由服务器完成。
    服务器负责整个系统的资源存储和管理
    客户机发挥其他的作用,共同实现完整功能。
    
    tcp/ip的cs架构:底层都是 物理层--链路层--网络层--传输层--应用层,底层实现客户端与服务端的通信
    应用层实现client端和server端
    

    网络中的常用组件

    服务器:分为文件服务器、应用程序服务器、数据库服务器等
    客户机(工作站):靠服务器进行管理和提供服务的、连入网络的任何计算机都是工作站
    网络适配器(网卡)
    网络通信电缆(常用的双绞线,同轴电缆)
    网络操作系统:NetWare、windou NT
    协议:通过协议进行数据传输,是网络层间和设备间相互通信的语言和规范,90%以上的网络通信用TCP/IP协议
    客户软件/服务软件
    

    INTERNET 是一个由不同规模和类型的计算机网络组成的全球性计算机网络,核心是TCP/IP协议和相关技术。

    TCP/IP协议
    tcp/ip是个协议族!
    TCP:传输控制协议、udp:用户数据协议、IP:Internet协议、FTP:文件传输协议、SMTP:简单邮件传输协议、ARP:地址解析协议
    
    TCP/IP分为4层有时也是5层:应用层、传输层、网络层、接口层(链路层、物理层)
    
    IP:网络地址+主机地址,分为ABCDEE类地址,
        a类子网掩码8位,0-126
        b类子网掩码16位,128-191
        c类24位。192-223
    

    ip地址不好记,全是数,然后就有了域名,就是网址,域名还分层,由dns服务器将域名转换做ip。

    几种数据通信服务
    ADSL:非对称数字用户线路,拨号上网
    ISDN:综合业务数据网,
    ATM:异步传输模式
        技术特点:定长信元,高速传输,异步传输,多路复用,支持各种数据传输服务
    
    Internet提供服务
    Telnet:主机远程登录
    FTP:远程文件传送,downnload,upload,还有匿名FTP服务
    USENET
    WWW服务,http服务(tc连接,80端口)
    浏览器:源IP,目标IP,协议,源主机端口,目标主机端口
    资源定位符URL
    超文本标记语言HTML
    超级链接:网页间的指向
    XML
    
    看一下HTML网页是怎么写的
    

    数据仓库和数据挖掘

    知识发现KDD和数据挖掘可以发现:

    1.广义知识
    2.关联知识
    3.分类知识
    4.预测性知识
    

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