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sklearn的各种聚类算法使用教程

sklearn的各种聚类算法使用教程

作者: Mr_Relu | 来源:发表于2019-05-14 21:49 被阅读0次

    编程环境:

    anaconda + Spyder
    Win10 + python3.6
    完整代码及数据已经更新至GitHub,欢迎fork~GitHub链接


    声明:创作不易,未经授权不得复制转载
    statement:No reprinting without authorization


    内容概述:

    • 测试sklearn中以下聚类算法在tweets数据集上的聚类效果
    • 使用NMI(Normalized Mutual Information)作为评价指标
    • sklearn聚类资料链接

    一、sklearn提供的各种聚类方法简介:

    image.png
    其中各种方法的原理实现可以查看Sklearn的官方文档,不再赘诉。链接如下:
    https://scikit-learn.org/stable/modules/clustering.html#

    二、对tweet数据集的简单处理:

    根据每条推特都有很整齐的格式,可以简单处理出需要的tweet内容文字和true_label,具体实现函数如下:
    处理后得到

    • ground_truth #每条推特的正确聚类标签[37,5,8,58......]
    • tweets_list #处理过的推特内容列表[推特内容1,内容2,......]。
    def token(line):    
        index = line.index(",")
        Text = line[10:index-1]
        cluNumber = line[index+12:-2]
        return (Text,cluNumber)
    
    def tweets_process():
        global ground_truth,tweets_list
        print("tweets processing...")
        f = open(r"C:\Users\93568\Documents\GitHub\DataMining\work5Clustering with sklearn\data\Homework5Tweets.txt")  
        lines = f.readlines()#读取全部内容    
        for line in lines:       
            (text,cluNumber) = token(line)      
            number = int(cluNumber)
            tweets_list.append(text)
            ground_truth.append(number)
    

    三、将tweet表示为tfidf的矩阵:

    利用python提供的特征提取的工具包:

    from sklearn.feature_extraction.text import  TfidfVectorizer
    
    def get_tfidf_matrix():
        global tfidf_matrix,tweets_list
        tfidf_vectorizer = TfidfVectorizer(tokenizer=token_split, lowercase=True)
        '''
        tokenizer: 指定分词函数
        lowercase: 在分词之前将所有的文本转换成小写,因为涉及到中文文本处理,
        所以最好是False,本tweet数据集已经全是小写可设为True
        '''    
        #tfidf_matrix = tfidf_vectorizer.fit_transform(tweets_list)
        #上面一行代码等价于下面两行代码
        tfidf_vectorizer.fit(tweets_list)
        tfidf_matrix = tfidf_vectorizer.transform(tweets_list)
    #    joblib.dump(tfidf_matrix, 'tfidf_matrix.pkl')
    #    tfidf_matrix = joblib.load('tfidf_matrix.pkl')
    

    四、运行结果及一些问题:

    (1)KMeans:

    max_iter=200, n_init=20, init='k-means++':


    #####
    (2) AffinityPropagation:
    image.png
    (3) MeanShift:

    开始输入相同的tfidf矩阵时出现
    TypeError: A sparse matrix was passed, but dense data is required. Use X.toarray() to convert to a dense numpy array.(使用toarray()/todense()后结果如下:)

    image.png
    可能是密度质心的方法对于高维数据结果很差,输出的标签结果都是0: image.png
    (4)DBSCN:

    没有进行调参,默认参数运行结果如下:


    image.png
    (5)SpectralClustering、ward hierarchical clustering、AgglomerativeClustering、Birch:
    image.png
    (6)Gaussian mixtures:略…

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