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统计三代fastq测序数据里的reads长度范围

统计三代fastq测序数据里的reads长度范围

作者: 小明的数据分析笔记本 | 来源:发表于2021-11-20 16:29 被阅读0次

    fastq格式 使用 seqkit这个工具

    seqkit帮助文档的链接
    https://bioinf.shenwei.me/seqkit/usage/#stats

    命令

    seqkit stats -a N01.filt.fq.gz -T
    

    返回结果

    image.png

    指标还挺多的 主要就是为了看N50

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