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统计-实验设计中,该怎么设置重复?

统计-实验设计中,该怎么设置重复?

作者: PriscillaBai | 来源:发表于2018-06-07 18:38 被阅读0次

    实验设计的重复分两种:技术重复(technical replicate)和生物重复(biological replicate)。

    1. 技术重复:

    同一个样本,重复三次。此时样本量=1

    技术重复

    2.生物重复:

    取多个样本,进行多次实验。此时样本量=3

    生物重复

    该选择哪种重复?

    1. 最理想的设计是兼顾技术重复和生物重复,但是由于资金的限制,只选生物重复也可,如RNA-seq。

    2. 在研究一个个体时选择技术重复,在研究一个组时选择生物重复。

    特殊情况,如两个样本有相关性(双胞胎)怎么办?

    有效样本量=样本量/ 1+(样本量-1)*相关系数

    如:两个样本相关系数=0.7     有效样本量=2/ 1+(2-1)*0.7=1.18

    存在相关性的样本

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