实验设计的重复分两种:技术重复(technical replicate)和生物重复(biological replicate)。
1. 技术重复:
同一个样本,重复三次。此时样本量=1
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2.生物重复:
取多个样本,进行多次实验。此时样本量=3
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该选择哪种重复?
1. 最理想的设计是兼顾技术重复和生物重复,但是由于资金的限制,只选生物重复也可,如RNA-seq。
2. 在研究一个个体时选择技术重复,在研究一个组时选择生物重复。
特殊情况,如两个样本有相关性(双胞胎)怎么办?
有效样本量=样本量/ 1+(样本量-1)*相关系数
如:两个样本相关系数=0.7 有效样本量=2/ 1+(2-1)*0.7=1.18
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