2019-08-16

今天1天都在安装R package，并测试。现在总结一下。吸取一些教训。

第一，首先是安装一个有关免疫的包：immunedeconv。说实话，很难安装，从最初的用Linux系统，用ubantu下载，好不容易下载完成了，不会载入。

今天，从新用rstudio来试试。

安装过程中老是报错，不知道问题出现在哪里？

后来，我干脆把这个报错放在Google里搜索，还是那句话，你遇到的错误，别人可能早遇到过来，搜索看。

果然，看到简书里有篇也是同样的问题。https://www.jianshu.com/p/4bbb88204e8f

在R中安装github R包时弹出了下方的错误

解决办法：

在R的窗口上运行Sys.setlocale(category = "LC_ALL", locale = "us")即可解决

输入install_github('dviraran/xCell')，成功安装该包。

我按照他的办法试了一下，果然，可以下载了，由于这个包太大。中间在下载MCPcount的时候又提示下载失败。

这次的错误由于新花样了。

首先压缩文件是下载了。干脆直接手动安装。把。从rstudio界面的tools进入点解install，选择R包文件目录。就成功。