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用Python进行数据分析 第五章 Pandas入门 上

用Python进行数据分析 第五章 Pandas入门 上

作者: Jason数据分析生信教室 | 来源:发表于2021-08-30 23:46 被阅读0次

    Pandas是贯穿Python的主要工具,它所包含的数据结构和数据处理工具的设计使得在Python中进行数据清洗和分析非常快捷。Pandas经常和Numpy, SciPy以及可视化包matplotlib等一起使用。Pandas支持大部分Numpy风格的数组计算。但是和Numpy比起来,更加适合处理数据框类型的大型复杂数据。
    废话不多说,就从导入pandas包开始吧。

    import pandas as pd
    

    还可以从本地命名空间中导入Series和DataFrame。

    from pandas import Series, DataFrame
    

    ??? 啥意思,在下没懂

    5.1 pandas数据结构介绍

    说要熟悉两个工具,一个是Series还有一个是DataFrame,原来是这个意思,哦,懂了。

    5.1.1 Series

    Series是一种一维的数组型对象,包含了一个值序列,并且包含了数据标签,也就是索引(index)。最简单的序列可以仅仅由一个数组形成:

    In [44]: import pandas as pd
    
    In [45]: from pandas import Series, DataFrame
    
    In [46]: obj=pd.Series([4,7,-5,3])
    
    In [47]: obj
    Out[47]: 
    0    4
    1    7
    2   -5
    3    3
    dtype: int64
    

    交互环境中Series的字符串表示,索引在左边,值在右边。由于我们不为数据索引,默认生成的索引是0到N-1。所以可以通过values属性和index属性分别获得Series对象的值和索引。

    In [48]: obj.values
    Out[48]: array([ 4,  7, -5,  3])
    In [49]: obj.index
    Out[49]: RangeIndex(start=0, stop=4, step=1)
    

    通常创建一个索引序列,要用标签(index)识别每个数据点:

    In [60]: obj2=pd.Series([4,7,-5,3],index=['b','d','a','c'])
    In [61]: obj2
    Out[61]: 
    b    4
    d    7
    a   -5
    c    3
    dtype: int64
    

    可以直接call出index。

    In [62]: obj2.index
    Out[62]: Index(['b', 'd', 'a', 'c'], dtype='object')
    

    与Numpy的数组相比,可以在从数据中选择数据时使用标签来进行索引。

    In [67]: obj2['a']
    Out[67]: -5
    In [68]: obj2['d']=6
    In [69]: obj2
    Out[69]: 
    b    4
    d    6
    a   -5
    c    3
    dtype: int64
    In [70]: obj2[['c','a','d']]
    Out[70]: 
    c    3
    a   -5
    d    6
    dtype: int64
    

    上面的例子中,['c','a','d']包含的不是数字而是字符串,作为索引列表。
    也可以使用Numpy类似的用法,

    In [71]: obj2[obj2>2]
    Out[71]: 
    b    4
    d    6
    c    3
    dtype: int64
    
    In [72]: obj2*2
    Out[72]: 
    b     8
    d    12
    a   -10
    c     6
    dtype: int64
    
    In [73]: np.exp(obj2)
    Out[73]: 
    b     54.598150
    d    403.428793
    a      0.006738
    c     20.085537
    dtype: float64
    In [74]: obj2[obj2>0]
    Out[74]: 
    b    4
    d    6
    c    3
    dtype: int64
    

    也可以把Seires看作是一个长度固定且有序的字典。

    In [75]: 'b' in obj2
    Out[75]: True
    
    In [76]: 'e' in obj2
    Out[76]: False
    

    如果已经有数据包含在Python字典,可以使用这个字典数据生成Series数据。

    In [77]: sdata={'Ohio':35000,'Texas':71000,'Oregon':16000,'Utah':5000}
    
    In [78]: obj3=pd.Series(sdata)
    
    In [79]: obj3
    Out[79]: 
    Ohio      35000
    Texas     71000
    Oregon    16000
    Utah       5000
    dtype: int64
    

    也可以自定义索引来查找数据,

    In [80]: states=['California','Ohio','Oregon','Texas']
    
    In [81]: obj4=pd.Series(sdata,index=states)
    
    In [82]: obj4
    Out[82]: 
    California        NaN
    Ohio           35000.0
    Oregon         16000.0
    Texas          71000.0
    dtype: float64
    

    上面的例子里由于原Series数据里没有California,所以返回了NaN。

    pandas中使用isnullnotnull函数来检查缺失数据。

    In [83]: pd.isnull(obj4)
    Out[83]: 
    Canlifornia     True
    Ohio           False
    Oregon         False
    Texas          False
    dtype: bool
    
    In [84]: pd.notnull(obj4)
    Out[84]: 
    Canlifornia    False
    Ohio            True
    Oregon          True
    Texas           True
    dtype: bool
    

    isnullnotnull也是Series的实用方法。

    In [85]: obj4.isnull()
    Out[85]: 
    Canlifornia     True
    Ohio           False
    Oregon         False
    Texas          False
    dtype: bool
    

    Series还有自动对齐索引的功能。

    In [86]: obj3+obj4
    Out[86]: 
    Canlifornia         NaN
    Ohio            70000.0
    Oregon          32000.0
    Texas          142000.0
    Utah                NaN
    dtype: float64
    

    Series对象自身和其索引都有name属性,这个特性和pandas其他重要功能集成在一起。

    In [87]: obj4.name='population'
    
    In [88]: obj4.index.name='state'
    
    In [89]: obj4
    Out[89]: 
    state
    Canlifornia        NaN
    Ohio           35000.0
    Oregon         16000.0
    Texas          71000.0
    Name: population, dtype: float64
    

    ??没懂,index.name是给全体序列名命名?

    In [90]: obj
    Out[90]: 
    0    4
    1    7
    2   -5
    3    3
    dtype: int64
    In [91]: obj.index=['Bob','Steve','Jeff','Ryan']
    
    In [92]: obj
    Out[92]: 
    Bob      4
    Steve    7
    Jeff    -5
    Ryan     3
    dtype: int64
    

    5.1.2 DataFrame

    尽管DataFrame是二维的,但是可以利用分层索引在DataFrame中展现更高维度的数据。分层索引会在后面出现。
    最常用的方式是利用包含等长度列表或Numpy数组的字典来形成DataFrame。

    In [96]: data={'state':['Ohio','Ohio','Ohio','Nevada','Nevada','Nevada'],
        ...:       'year':[2000,2001,2002,2001,2002,2003],
        ...:       'pop':[1.5,1.7,3.6,2.4,2.9,3.2]}
    
    In [97]: frame=pd.DataFrame(data)
    
    In [98]: frame
    Out[98]: 
        state  year  pop
    0    Ohio  2000  1.5
    1    Ohio  2001  1.7
    2    Ohio  2002  3.6
    3  Nevada  2001  2.4
    4  Nevada  2002  2.9
    5  Nevada  2003  3.2
    

    对于大型的DataFrame,可以用head来显示前五行。

    In [8]: data={'state':['Ohio','Ohio','Ohio','Nevada','Nevada','Nevada'],
       ...:       'year':[2000,2001,2002,2001,2002,2003],
       ...:       'pop':[1.5,1.7,3.6,2.4,2.9,3.2]}
    
    In [9]: frame=pd.DataFrame(data)
    
    In [10]: frame
    Out[10]: 
        state  year  pop
    0    Ohio  2000  1.5
    1    Ohio  2001  1.7
    2    Ohio  2002  3.6
    3  Nevada  2001  2.4
    4  Nevada  2002  2.9
    5  Nevada  2003  3.2
    
    In [11]: frame.head()
    Out[11]: 
        state  year  pop
    0    Ohio  2000  1.5
    1    Ohio  2001  1.7
    2    Ohio  2002  3.6
    3  Nevada  2001  2.4
    4  Nevada  2002  2.9
    

    如果制定了列的顺序,DataFrame的列将会按照指定顺序排列。

    In [13]: pd.DataFrame(data,columns=['year','state','pop'])
    Out[13]: 
       year   state  pop
    0  2000    Ohio  1.5
    1  2001    Ohio  1.7
    2  2002    Ohio  3.6
    3  2001  Nevada  2.4
    4  2002  Nevada  2.9
    5  2003  Nevada  3.2
    

    如果指定的列不再DataFrame里的话则会出现缺失值:

    In [14]: frame2=pd.DataFrame(data,columns=['year','state','pop','debt'],
        ...:                     index=['one','two','three','four','five','six'])
    
    In [15]: frame2
    Out[15]: 
           year   state  pop debt
    one    2000    Ohio  1.5  NaN
    two    2001    Ohio  1.7  NaN
    three  2002    Ohio  3.6  NaN
    four   2001  Nevada  2.4  NaN
    five   2002  Nevada  2.9  NaN
    six    2003  Nevada  3.2  NaN
    

    DataFrame中的一列,可以按字典型标记或属性那样检索为Series:

    In [17]: frame2['state']
    Out[17]: 
    one        Ohio
    two        Ohio
    three      Ohio
    four     Nevada
    five     Nevada
    six      Nevada
    Name: state, dtype: object
    

    也可以用

    In [18]: frame2.year
    Out[18]: 
    one      2000
    two      2001
    three    2002
    four     2001
    five     2002
    six      2003
    Name: year, dtype: int64
    

    好神奇,赞了赞了,可读性比R语言瞬间高了一个档次

    也可以通过为止或特殊属性loc进行选取,相当于把数据结构横了过来?

    In [19]: frame2.loc['three']
    Out[19]: 
    year     2002
    state    Ohio
    pop       3.6
    debt      NaN
    Name: three, dtype: object
    

    列的引用也可以修改。例如,空的'debt'列可以赋值为标量值或数组值

    frame2['debt']=16.5
    
    frame2
    Out[21]: 
           year   state  pop  debt
    one    2000    Ohio  1.5  16.5
    two    2001    Ohio  1.7  16.5
    three  2002    Ohio  3.6  16.5
    four   2001  Nevada  2.4  16.5
    five   2002  Nevada  2.9  16.5
    six    2003  Nevada  3.2  16.5
    
    In [25]: frame2
    Out[25]: 
           year   state  pop  debt
    one    2000    Ohio  1.5   0.0
    two    2001    Ohio  1.7   1.0
    three  2002    Ohio  3.6   2.0
    four   2001  Nevada  2.4   3.0
    five   2002  Nevada  2.9   4.0
    six    2003  Nevada  3.2   5.0
    

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