下载miniconda
1.搜索conda官网,找到下载链接
2.ctrl+c复制链接
3.打开putty,cd biosoft
4.wget+右键粘贴链接
5.bash+刚下的文件
6.enter跳过加yes即可安装
7.最后激活:source ~/.bashrc
8.添加清华镜像:conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
运行miniconda
1.用conda list来查看
2.用conda search fastqc来搜索fastqc软件
3.conda install fastqc -y来安装
4.conda remove fastqc -y来卸载
备注:
我在添加清华镜像的时候出现了错误,这时可尝试rm ~/.condarc来删除之前的配置,这样就可以继续添加了!!
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