地图是数据可视化的一部分,做群体遗传学、动物学、植物学等的朋友经常用到地图,比如绘制样品采样点分布,物种分布等等。前几天我们编写了带数据点分布的世界地图,今天给大家带来一张满怀期待的祖国地图。发挥想象力,收集你的数据,将其呈现在中国地图上,也许能够从图中找到数据分布规律,甚至可以把你的足迹也呈现在地图上,不光具有科学性,还具有趣味性,赶紧来看看吧。
1, 1,打开绘图页面
首先,使用浏览器(推荐chrome或者edge)打开中国地图绘图页面。
http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_china_map_with_scatter_points_plot_195
左侧为常见作图导航,中间为数据输入框和可选参数,右侧为描述和结果示例。
图1.可视化页面
2,示例数据
点击右侧“示例数据”链接下载excel格式的示例数据。
示例数据(仅供参考)包括4列:
第1列是位置的名字(实际结果中未使用该列数据的信息);
第2列是纬度;
第3列是经度;
第4列是分组信息(最多支持5种分类)
注意:你需要参考示例数据,将自己的位点信息在excel中整理成示例数据的样式。
图2. 输入数据示例
3,粘贴示例数据
直接拷贝示例数据中的ABCD 4列数据,然后粘贴到输入框。
图3. 必需输入
注意:不是拷贝excel文件,是拷贝excel文件里边的数据哦。另外粘贴到输入框后,格式乱了没关系,只要在excel中是整齐的就行。并且数据矩阵中不能有空的单元格,中文字符等。
4,修改参数,并提交
我们设置了图片尺寸,图例文字大小,标题,颜色,字体等参数,基本能满足日常绘图使用。如需更高级的定制,请联系我们。
部分参数详解:
散点大小:控制点的大小,若点很多,可以将该参数适当调小。
南海诸岛子图:即将南海诸岛以子图的形式展示在大图右下角。
经纬度:是否标注经纬度,即图片上的水平和垂直线。
注意:由于使用了merc投影,因此地图的长宽比例是固定的,不会随着图片的拉伸而拉伸。
图4. 颜色等参数
5,提交出图
粘贴好数据,调整好参数后,点击提交按钮,约5秒后,在页面右侧会出现结果预览图。我们提供了4种图片格式供下载使用,两种矢量图(pdf,svg)和两种标量图(600 dpi tiff和300 dpi png)。
图中红色点表示北上广深4个一线城市,蓝色点表示其他城市。
注意:图片数据信息来自网络,仅供交流学习之用。
图5. 中国地图可视化结果
没有预览就是没有出图,这时请参考示例数据,检查并调整输入数据格式!
最后,让我们再来回顾下微生信作图三部曲。
图6. 微生信绘图步骤
遇到文字截断,需要修改字体、调整字体大小等,使用scape软件。
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