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RBP AS生信流程( 附)软件安装

RBP AS生信流程( 附)软件安装

作者: cHarden13 | 来源:发表于2020-08-31 11:12 被阅读0次

    samtools

    尝试了各种方法后,最后用conda install samtools安装成功

    Piranha

    安装参考http://smithlabresearch.org/software/piranha/

    Piranha -help #可以使用
    

    HOMER

    参考:http://homer.ucsd.edu/homer/ngs/peakMotifs.html
    https://mp.weixin.qq.com/s/a4qAcKE1DoukpLVV_ybobA

    #建立名为homer的文件夹并进入
    wget http://homer.salk.edu/homer/configureHomer.pl 
    perl configureHomer.pl -install  
    #加入路径:
    echo 'export PATH=/home/sxw/biosofts/homer/bin:$PATH' >>~/.bashrc
    source ~/.bashrc
    findMotifs.pl#成功,可运行
    

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