1. 什么是序列比对?序列比对的目的、意义和用途是什么?
1.1:序列比对(sequence alignment):
是利用特定的数学模型或者是算法,找到两个或多个序列之间的最大匹配的碱基数或氨基酸残基数,其结果反映了序列之间的相似性关系以及他们的生物学特征。
1.2:序列比对的目的:
推断序列之间在结构、功能和进化方面的关系。其意义是分析序列之间在单个核苷酸或氨基酸水平上的相似性和差异性。
1.2:序列比对的用途:
- 基因预测
- 分析基因或蛋白质的功能
- 分析物种进化
- 检测突变、插入或缺失
2. 如何判断找到的序列是同源序列?
Alignment score 和E(expect)value
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