RNA作为遗传信息传递与调控分子,在各种细胞生命活动中发挥着至关重要的作用。细胞中,RNA合成、加工、转运、翻译、降解以及功能发挥都需要有蛋白质的直接参与,这类与RNA直接结合的蛋白质就称为RNA结合蛋白(RNA binding protein,RBP)。RBP通过其RNA结合域(RNA-binding domain,RBD)直接与RNA结合,以核糖核酸蛋白复合物(Ribonucleoprotein,RNP)的形式,参与细胞生命活动调节。今天分享的是一个收集整理了来自于163个真核生物的315,222个RBP的数据库——EURBPDB。
EURBPDB三言两语
1. 汇总163个真核生物的RBP,并进行分类整理。
2.提供了基于TCGA等癌症大数据的RBP表达与突变图谱。
3.提供在线判断蛋白是否为RBP的工具。
Reference
Liao, J.-Y. et al. EuRBPDB: a comprehensive resource for annotation, functional and oncological investigation of eukaryotic RNA binding proteins (RBPs). Nucleic Acids Res. 48, D307-D313 (2020).
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