tRNAscan-SE 能在基因组水平上进行tRNA扫描。该软件实际上是一个perl 脚本，整合了tRNAscan、EufindRNA 和Cove 这3个独立的tRNA检测软件。tRNAscan-SE 首先调用 tRNAscan和EufindRNA鉴定基因组序列中 tRNA区域，然后调用Cove进行验证。这样既保证了前者的sensitivities， 又保证了后者较低的假阳性概率，同时在搜索速度上提升了很多。
有关tRNAscan-SE 的详细说明，参考其本地化软件包中的 man 文档。
tRNAscan-SE使用说明https://blog.csdn.net/herokoking/article/details/77853662
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本文标题：tRNAScan-SE v2.0
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