小插曲:唉,之前不小心把R包全删除了。。。导致在练习的时候又要重新安装包,紧接着就是出错出错再出错
参考生信技能书下载GSE数据方法
remotes::install_github("jmzeng1314/GEOmirror")
eSet=geoChina('GSE12417')
##出现了下面的报错信息
Error in utils::download.file(url, path, method = method, quiet = quiet, : cannot open URL 'https://api.github.com/repos
于是,换了另一种方式
library(remotes)
url='https://gitee.com/jmzeng/annoprobe.git'
install_git(url)
gset=geoChina('GSE126294')
就可以下载数据啦!
[参考] :https://my.oschina.net/u/4503882/blog/4415881
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