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2021-04-13 下载GSE数据又出错了

2021-04-13 下载GSE数据又出错了

作者: 学习生信的小兔子 | 来源:发表于2021-04-13 18:28 被阅读0次

    小插曲:唉,之前不小心把R包全删除了。。。导致在练习的时候又要重新安装包,紧接着就是出错出错再出错
    参考生信技能书下载GSE数据方法

    remotes::install_github("jmzeng1314/GEOmirror")
    eSet=geoChina('GSE12417')
    ##出现了下面的报错信息
    Error in utils::download.file(url, path, method = method, quiet = quiet, : cannot open URL 'https://api.github.com/repos
    

    于是,换了另一种方式

    library(remotes)
    url='https://gitee.com/jmzeng/annoprobe.git'
    install_git(url)
    gset=geoChina('GSE126294')
    

    就可以下载数据啦!
    [参考] :https://my.oschina.net/u/4503882/blog/4415881

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