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LOF算法的代码实现

LOF算法的代码实现

作者: 谜一样的巴扎嘿 | 来源:发表于2018-11-27 10:47 被阅读268次

https://zhuanlan.zhihu.com/p/37753692
在这个文章里面有个关于LOF算法比较具体的实现步骤
在sklearn包里面有LOF的库,可以直接调用。
核心代码:

clf=LocalOutlierFactor(n_neighbors=20,algorithm='auto',contamination=0.1,n_jobs=-1,p=2)

●n_neighbors=20:即LOF算法中的k的值,检测的邻域点个数超过样本数则使用所有的样本进行检测
●algorithm = 'auto':使用的求解算法,使用默认值即可
●contamination = 0.1:范围为 (0, 0.5),表示样本中的异常点比例,默认为 0.1
● n_jobs = -1:并行任务数,设置为-1表示使用所有CPU进行工作
● p = 2:距离度量函数,默认使用欧式距离。(其他距离模型使用较少,这里不作介绍。具体参考官方文档

clf.fit(data)

无监督学习,只需要传入训练数据data,就可以训练出LOF算法模型,不过输入数据的维度至少是二维

clf.kneighbors(data)

●获取到k距离邻居内的每个点到中心点的距离,并从小到大排列
●返回2nk数组,包含[距离,样本检索]

clf.decision_function(data)

●获取每个样本点的LOF值,不过输出结果是LOF值的相反数,需要取反
●这个函数是在clf.predict(data)的基础上进行改进的,会有更多的功能。
●clf.predict(data)会给出异常点的判断,异常值返回-1,正常值返回1;

实战实例

采用的数据是2017年全国大学生数学建模竞赛B题数据

1、LOF算法部分

def localoutlierfactor(data, predict, k):
    from sklearn.neighbors import LocalOutlierFactor
    clf = LocalOutlierFactor(n_neighbors=k + 1, algorithm='auto', contamination=0.1, n_jobs=-1)
    clf.fit(data)
    # 记录 k 邻域距离
    predict['k distances'] = clf.kneighbors(predict)[0].max(axis=1)
    # 记录 LOF 离群因子,做相反数处理
    predict['local outlier factor'] = -clf._decision_function(predict.iloc[:, :-1])
    return predict

def plot_lof(result, method):
    import matplotlib.pyplot as plt
    plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei']  # 用来正常显示中文标签
    plt.rcParams['axes.unicode_minus'] = False  # 用来正常显示负号
    plt.figure(figsize=(8, 4)).add_subplot(111)
    plt.scatter(result[result['local outlier factor'] > method].index,
                result[result['local outlier factor'] > method]['local outlier factor'], c='red', s=50,
                marker='.', alpha=None,
                label='离群点')
    plt.scatter(result[result['local outlier factor'] <= method].index,
                result[result['local outlier factor'] <= method]['local outlier factor'], c='black', s=50,
                marker='.', alpha=None, label='正常点')
    plt.hlines(method, -2, 2 + max(result.index), linestyles='--')
    plt.xlim(-2, 2 + max(result.index))
    plt.title('LOF局部离群点检测', fontsize=13)
    plt.ylabel('局部离群因子', fontsize=15)
    plt.legend()
    plt.show()

def lof(data, predict=None, k=5, method=1, plot=True):
    import pandas as pd
    # 判断是否传入测试数据,若没有传入则测试数据赋值为训练数据
    try:
        if predict == None:
            predict = data.copy()
    except Exception:
        pass
    predict = pd.DataFrame(predict)
    # 计算 LOF 离群因子
    predict = localoutlierfactor(data, predict, k)
    if plot == True:
        plot_lof(predict, method)
    # 根据阈值划分离群点与正常点
    outliers = predict[predict['local outlier factor'] > method].sort_values(by='local outlier factor')
    inliers = predict[predict['local outlier factor'] <= method].sort_values(by='local outlier factor')
    return outliers, inliers

详细的代码见上,可以发现,其实这三个函数就是在LOF库的基础上进行了判断和丰富。

2、导入数据进行判断

import numpy as np
import pandas as pd

# 根据文件位置自行修改
posi = pd.read_excel(r'E:\\CNOOC_drilling\\11month\\离群点异常点\\已结束项目任务数据.xls')
lon = np.array(posi["任务gps经度"][:])  # 经度
lat = np.array(posi["任务gps 纬度"][:])  # 纬度
A = list(zip(lat, lon))  # 按照纬度-经度匹配

# 获取任务密度,取第5邻域,阈值为2(LOF大于2认为是离群值)
outliers1, inliers1 = lof(A, k=5, method = 2)

zip函数代表的是将两个对象中对应的元素进行打包,打包成元组,在菜鸟教程里面有详细解释:

a = [1,2,3]
b = [4,5,6]
c = [4,5,6,7,8]
zipped = zip(a,b) # 打包为元组的列表
输出:[(1, 4), (2, 5), (3, 6)]
zip(a,c) # 元素个数与最短的列表一致
输出:[(1, 4), (2, 5), (3, 6)]
zip(zipped) # 与 zip 相反,zipped 可理解为解压,返回二维矩阵式
输出:[(1, 2, 3), (4, 5, 6)]

结果:



从图片可以看出根据设定的k值的不同,离群点会根据下方的虚线进行不同的设定,纵坐标代表的就是LOF的值,也就是说method大于2会被认为是离群点。



这个图更加的直观,横纵坐标分别表示数据中的经、纬度,对于不同的离群点数据,偏离程度越大,其周围的红色的圈越大,也就是表示在很大的区域内都没有邻近点。

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