#格式转换
vcftools --vcf total.final.snp.vcf --plink --out xj
#过滤
plink --noweb --file xj --geno 0.05 --maf 0.05 --hwe 0.0001 --make-bed --out QC
# plink --file xj --make-bed --out QC
#生成Q矩阵
for K in 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10;do admixture --cv QC.bed $K|tee log${K}.out;done
#格式转换 vcftools --vcf total.final.snp.vcf --plink --out xj...
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本文标题：群体结构structure
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/yuxnrltx.html
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