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用Evolview美化系统发育树，简单又高级

Evolview——一款强大的进化树在线编辑软件。它可以制作出高颜值的进化树，并且提供17种示例树，以及5个具体项目示例。

它还可以导出多种格式的文件，包括pdf、svg、tiff、png，而且绘制完成的进化树可永久性的保存在网站里，也可进行共享。下面我们就来介绍一下Evolview的使用方法：

一、生成物种树

网址：http://www.evolgenius.info/evolview/#login注册账号,登录：

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操作栏共分四栏：基础、高级、注释与导出

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首先，把树上传

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上传之后，可以把树导出为svg的矢量格式

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可以选择物种树的表现形式：进化分支图（不带枝长），系统发生图（带枝长）、斜向进化分支图、圆形进化分支图、圆形系统发生图

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（进化分支图）

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（系统发生图）

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（斜向进化分支图）

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(圆形进化分支图)

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(圆形系统发生图)更改枝的边角

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圆角

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斜角网页模式，字体变小

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显示支持率、支持率斜体与字体大小

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显示枝长、枝长斜体与字体大小

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显示物种名方式

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放大缩小选项

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图像占屏幕比例

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扩展与压缩图像

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物种名字体

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枝的粗细

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调整角度

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开始注释

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由于图片数量限制，更全图标解读含义可在公号科研日精进内查看。

示例树和具体项目

此外，网站还提供了17种类型的示例树，以及5个具体项目示例。

1. yeast duplications（饼图）Duplication（两种颜色）

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overlap with WGD（两种颜色）

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overlap with other duplicates（四种颜色）

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pie with strokes（加圆圈）

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pie with data values shown（显示具体值）

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2. ensembl compara 2011（分枝颜色）Branch Colors（分枝颜色）

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Mouse（物种名内圈颜色）

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back ground（物种名内圈颜色）

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Charts（物种名外圈颜色）

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3. a demo of datasets（叶片颜色）branch colors（分枝颜色）

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leaf colors（叶片颜色）

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leaf background colors（叶片背景色）

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bars（条形图）

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color strips（多边形）

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4. bars（条形图）bars1（条形图1）

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bars2 with data shown（条形图2显示数据）

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5. leaf decoration and stroke（叶片装饰）leaf deco and stroke（叶片装饰1）

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leaf deco and stroke（叶片装饰2）

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6. protein domain（蛋白结构域）

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7.分组标签1、2branch color to root（到树根的颜色）

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leaf colors（叶片颜色）

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style 5（树枝分组）

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style 2（叶片分组）

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default style（附加分组）

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8. group label style 3（分组风格3）

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9. group label style 4（分组风格4）

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10点状图with strokes（圆形带圈）

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rect without strokes（正方形不带圈）

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11.热图

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12.列状图

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13.bootstrap值bootstrap 1

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bootstrap 2

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bootstrap 3

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bootstrap 4

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bootstrap 5

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bootstrap 6

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14.物种名

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15.多bootstrap值

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16.时间轴

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17.网页模式leaf label green

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leaf label pink

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另外，还有五个项目示例：1.

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2.

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3.

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4.

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5.

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好了，以上就是使用使用Evolview对系统发育树进行美化操作。软件、测试数据，需要的小伙伴请关注。