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大麦常用网站

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作者: 夏大希 | 来源:发表于2022-07-27 10:21 被阅读0次

1.大麦各版本注释下载

Galaxy (ipk-gatersleben.de)

image.png
由于第二版本的比对率相同的测序样品相同的比对软件和参数,导致不同参考基因组之间的比对率差异很大,所以想这从Hv_IBSC_PGSB1再进行分析
大麦参考基因组Morex_V2的下载地址
e!DAL - PGP Repository - gene_annotation (ipk-gatersleben.de)
image.png

另外一个就是ensemble plant
Index of /pub/plants/release-54/gff3/ (ensemblgenomes.org)

image.png
Index of /pub/plants/release-54/fasta/ (ensemblgenomes.org) image.png

2.大麦blast

Home (ipk-gatersleben.de)
Crop Analysis Tools Suite - IPK Gatersleben (ipk-gatersleben.de)

image.png

3.其他网站

点击BRIDGE可以在线展示大麦的GWAS结果


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