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基因组数据下载随笔 2020-04-28

基因组数据下载随笔 2020-04-28

作者: SnorkelingFan凡潜 | 来源:发表于2020-04-28 17:23 被阅读0次
    • 在NCBI上下载的数据集有的含有gff,有的不含gff。如果没有就说明该物种还没有注释或者注释的结果还没有上传。
    • 不一定都在NCBI上下载,有的蛋白质注释文件在原项目官网可以下载,比如;

    https://www.hgsc.bcm.edu/arthropods/i5k
    ftp://ftp.hgsc.bcm.edu/I5K-pilot/

    image.png
    image.png
    i5K Pilot Project
    ftp://ftp.hgsc.bcm.edu/I5K-pilot//Brown_recluse_spider
    ftp://ftp.hgsc.bcm.edu/I5K-pilot//Common_house_spider
    ftp://ftp.hgsc.bcm.edu/I5K-pilot//Western_black_widow_spider
    

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