2021.8月
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肿瘤免疫浸润相关性分析模块又分为四个部分:基因分析、突变、拷贝数变异、临床结局。
TIMER2数据库可以系统的分析不同癌症类型的免疫浸润,不仅能探索基因与肿瘤免疫浸润的关系,还可以探索基因表达和临床预后。
以下是官网网址:
http://timer.comp-genomics.org/
在详细介绍之前,放上一组数据让大家直观感受下SEER 数据库的魅力:
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【2】生信联合药物分析?你需要这个数据库
【3】RNASeq表达量的各种M的统计方法,把你绕晕了吗?
【4】药物生信分析利器—药物数据库【多个数据库,详细操作步骤】
GDSC主要包括了药物敏感性基因特征分析、细胞系药物敏感性数据、细胞系多组学数据等三个方面的数据。
DrugBank是阿尔伯塔大学将详细的药物数据和全面的药物目标信息结合起来,结果都是有实验验证过的、真实可靠的生物信息学和化学信息学数据库。
【5】王炸!生信联合药物分析新套路,用这个数据库,立马高级!
cellMiner数据库的使用及药物敏感性预测,里面有详细的操作步骤。
CellMiner数据库,主要是通过国家癌症研究所癌症研究中心(NCI)所列出的60种癌细胞为基础而建立的。该数据库最初发表于2009年,后于2012年在Cancer Research杂志上进行了更新,题目为“CellMiner: a web-based suite of genomic and pharmacologic tools to explore transcript and drug patterns in the NCI-60 cell line set”。大家后期在使用该数据库记得应用相关文献。
【6】联合多数据库,研究癌症基因组学必备神器
名称:GSCALite
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网址:http://bioinfo.life.hust.edu.cn/web/GSCALite/
【里面内容较多,有甲基化, 推荐】
这个网站的优势就在于涵盖了多数据库,而且还可以集SNV、CNV、miRNA互作用、与药敏研究于一身,是生信文章分析、实验前指标筛选、基因通路预测的完美工具。这么多分析功能的科研神器,相信将来你一定会用到。
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【7】临床必备!超好用的肿瘤突变生信数据库推荐(内附详细讲解)
【8】干货来啦!肿瘤生信挖掘必备数据库大合集!看这篇就够了!
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2021.9
【01】手把手教你一个不一样的通路富集分析工具—ActivePathways
【02】TMErisk研究终于出新思路了
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