本次阅读的文献是2019年发表在《Current biology》上《Mate Selection in Self-Compatible Wild Tobacco Results from Coordinated Variation in Homologous Self-Incompatibility Genes》,本文的通讯作者是德国马普化学生态所Ian T. Baldwin教授课题组。
Prof. Ian T. Baldwin在开花植物中不同植物演化出了不同的交配系统,例如自交或是异交又或是中间类型,不同的交配方式各有优势,其中最常见的就是异交的交配体系,由自交不亲和(SI)机制控制,自交不亲和主要指的是可育植物自交后无法产生后代的现象。自交不亲和是由单一的复等位基因位点控制,称之为S-locus,在茄科植物中,S-locus包含一个花粉表达的特异串联的F-box基因(SLF)和花柱特异表达的S-RNase,当自交时,S-RNases展现活性,从而将花粉管内的RNA水解,抑制花粉管的生长,在异交时,F-box基因能够和SSK1, CUL1蛋白组成SCF复合体特异性的去除掉S-RNase,从而保证花粉管的正常生长。在长柄龙葵中,SI群体的花柱被自交亲和(SC)群体的花粉授粉时,花粉排斥现象普遍存在,反之则不存在。这被称为种内单侧不亲和性,这被认为与该物种的SI-SC过渡有关。
茄科植物自交不亲和基因在自交亲和的Nicotiana attenuata中,作者鉴定到了两个 NaS-like-RNases和6个NaSLF-like genes以及一个NaSSK1和一个NaCUL1。为了探究在自交亲和植物中NaS-like-RNases与花粉选择的关系。他们对四种不同基因型的S-like-RNase1/2在花柱中蛋白丰度和选择表型进行了探究。四种种质资源(AZ, UT, G8, and G2)他们在花柱的S-like-RNase表达谱变化非常大,S-like-RNase1主要在AZ, UT的花柱中富集中,在G8和G2的含量就非常低,S-like-RNase2主要在AZ花柱中含量特别高,UT少量,G8 和 G2 的花柱中检测不到,如果S-like-RNases参与到了同种花粉的选择中,那么G8 和 G2由于S-like-RNases的丢失则会丧失交配方式选择的能力,于是作者就用UT and G8 或者 AZ and G8 的花粉去授粉给UT and G8 或是 AZ and G8 的植物,在子代进行鉴定作者发现UT 和 AZ 倾向于自己的花粉,而G8则对UT:G8 或是 AZ:G8来源的花粉不区分。同样的如果使用UT and G2 或是 AZ and G2 的花粉混合物受给 UT and G2 或是 AZ and G2 植物。AZ同样展现出对自己花粉结合的亲和力,而G2 则不能区分UT:G2 或是 AZ:G2的花粉。但是有趣的是,UT的花并没有对UT:G2花粉混合物中自己的花粉更加亲和。所以S-like-RNases的确是在同种花粉的选择中起作用的。
NaS-like-RNases参与交配选择为了进一步探究S-like-RNases的功能,他们进一步使用RNAi方式沉默掉AZ中的S-like-RNase1/2以及UT中的S-like-RNase1,相对于空载(EV)来说,沉默(SLR1)对UT:G8花粉选择的偏好性下降,而EV和SLR1则仍然不能区分UT:G2的花粉。对于AZ同理也是。因此NaS-like-RNase1和2是交配系统的决定因子,其蛋白丰度导致自然变异。
随后他们在四个种质资源中NaS-like-RNase的拷贝数目,发现S-like-RNase1在G2和G8中丢失,S-like-RNase2在四个种质资源中各有一份拷贝,说明S-like-RNase2丰度的变化不是基因缺失的结果。于是作者对序列差异进行查看,S-like-RNase1启动子中未发现SNP, AZ和ORF中发现一个SNP而S-like-RNase1会导致126位氨基酸的差异,但是是Asp还是Asn都能够在其他的S-RNase酶找到因此不是主要原因。接着在UT的S-like-RNase2中发现了一些SNP,序列与其他种质资源其实是等同的,因此作者认为SNP不足解释蛋白丰度的水平。于是作者联想到甲基化是否会存在影响,发现S-like-RNase1相邻的两个富含的胞嘧啶区域在UT和AZ之间的胞嘧啶甲基化有显著差异,S-like-RNase2在四个种质资源富含胞嘧啶的区域均有差异。并且通过比较26个种植资源中甲基化与S-like-RNase1/2的关系,发现两者密切相关。
S-like-RNase自然变异很高与编码区胞嘧啶甲基化相关下面为了进行说明交配方式是否进一步受到了SLF的影响,作者在UT and AZ 基因组中发现了一个SSK1, 一个CUL1和 14 SLF-like,在8个SLF-like基因的编码序列中发现了提前终止密码子,说明没功能,而其他6个(NaSLF-like1–6)是有功能的。而这六个NaSLF-like与SSK1以及CUL1的表达存在差异。NaSLF-like1 and 6的转录水平与S-like-RNase2呈现明显相关性,而NaSLF-like2 and 4与S-like-RNase1呈现明显相关性。通过酵母双杂显示,SLF-like1C端能够与S-like-RNase2相结合,而不与S-like-RNase1结合。此外NaSSK1与NaSLF-like1和NaCUL1的N端相互作用,暗示说NaSLFlike1可以与NaS-like-RNase2形成SCF降解复合体。
茄科SI相关表达量 酵母双杂为了确定SLF-like1和S-like-RNase2的相互作用是否参与花粉的选择,将SLF-like1进行RNAi,然后授给AZ以GZ和空载或是沉默的AZ花粉,发现同种花粉交配的倾向性明显下降。随后为了验证SLF-like2 or 4和S-like-RNase1相关性,同样的SLF-like2 和 4被分别或是同时被沉默,将这种花粉与空载和G8授粉给UT,发现SLF-like2沉默或是SLF-like2 和 4一起沉默,UT对于选择自己花粉的倾向性明显下降。说明SLF-like和S-like-RNase一起参与到同种花粉的花粉选择当中。
NaSLF-like1相对转录本丰度基于以上实验作者猜测植株优先选择来自S-like-Rnases表达水平与自身相似的植株的花粉,为了验证这个猜想,作者构建了irSLR1/UT(RNAi S-like-RNase1)和irSLR2/AZ(S-like-RNase2)植株,然后用14个种质资源依据S-RNase-like表达谱作为花粉供体进行授粉,发现授粉偏好性与表达谱相关。
花柱从具有类似S-like-RNase表达模式的植物中选择花粉
网友评论