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制作复方网络药理学

制作复方网络药理学

作者: Peng_001 | 来源:发表于2020-04-30 18:58 被阅读0次

参考:中药复方网络药理学:7. 复方成分及其网络框架的构建

准备工作

构建复方药理学前,需要按照之前的思路,构建每一个单体药物的数据表。可以参考:

  1. 将TCMSP 数据库信息匹配uniprot
  2. 使用cytospace 将数据可视化处理

ps:这里存在的问题是,不同的中药可能存在相同的靶点,如果需要用相关的自定义ID去替代TCMSP数据库中的MOLID,则需要考虑先将复方中的这些相同成分进行排列。

这一点上可以专门建立一个表格,用于标记具备重复值的药物。


视频中内容

可以通过下面方法来构建该列表:
首先在某个列表下创建复方相关信息,并记录复方中各个药材的靶点

接着在数据列表中选择条件格式

选择重复值便会突出重复的选项


将重复值单独制作一个表格,对重复值特殊命名,如


其他的参考步骤可以参考单味中药的分析流程
使用cytospace 将数据可视化处理
其实大同小异,只是由一个(药物-成分-靶点),复方-多个(药物-成分-靶点)。

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