目前拿到一个机器的Android系统签名，以JKS格式文件提供，要如何对APK签名呢？按如下步骤操作：
jarsigner -verbose -keystore xxx.jks -signedjar xxx_signed.apk xxx_unsigned.apk xxx_alias
其中，xxx.jdk为相应的签名文件，xxx_alias为签名文件里面配置的keystore别名。例如：
jarsigner -verbose -keystore xbh.jks -signedjar Explorer_signed.apk Explorer_unsigned.apk android
执行该命令后，要求输入keystore的密码，输入完后，碰到如下提示：
jarsigner: 无法对 jar 进行签名: java.util.zip.ZipException: invalid entry compressed size (expected 6716 but got 6831 bytes)
查了下资料，是由于APK已有签名了，于是执行如下命令删除到现有签名：
zip -d Explorer_unsigned.apk META-INF/\*
命令执行后有如下提示：
deleting: META-INF/MANIFEST.MF
deleting: META-INF/CERT.SF
deleting: META-INF/CERT.RSA
执行完该命令后，再执行上面的jarsigner命令重新签名即可，此时有如下提示输出：
正在添加: META-INF/MANIFEST.MF
正在添加: META-INF/ANDROID.SF
正在添加: META-INF/ANDROID.RSA
正在签名: res/drawable-1280x600/content_item.9.png
正在签名: res/drawable-1280x600/explorer_logo.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_apk.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_audio.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_copy.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_delete.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_folder.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_move.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_msg.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_other.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_paste.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_photo.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_rename.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_share.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_smb.png
正在签名: res/drawable-1280x600/icon_video.png
正在签名: res/drawable-1280x600/line_content.png
正在签名: res/drawable-1280x600/line_top.png
正在签名: res/drawable-1280x600/nav_flash1.png
正在签名: res/drawable-1280x600/nav_flash2.png
正在签名: res/drawable-1280x600/nav_network1.png
正在签名: res/drawable-1280x600/nav_network2.png
正在签名: res/drawable-1280x600/nav_sata1.png
正在签名: res/drawable-1280x600/nav_sata2.png
正在签名: res/drawable-1280x600/nav_sdcard1.png
正在签名: res/drawable-1280x600/nav_sdcard2.png
正在签名: res/drawable-1280x600/nav_usb1.png
正在签名: res/drawable-1280x600/nav_usb2.png
正在签名: res/drawable-1280x600/popup_win.png
正在签名: res/drawable-1280x600/popup_win1.9.png
正在签名: res/drawable-1280x600/shadow.png
正在签名: res/drawable-1280x600/smb_add.png
正在签名: res/drawable-1280x600/smb_delete.png
正在签名: res/drawable-1280x600/smb_edit.png
正在签名: res/drawable-1280x600/smb_search.png
正在签名: res/drawable-1920x900/background.png
正在签名: res/drawable-1920x900/content_item.9.png
正在签名: res/drawable-1920x900/explorer_logo.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_apk.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_copy.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_delete.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_folder.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_image.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_move.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_msg.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_music.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_other.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_paste.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_rename.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_share.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_smb.png
正在签名: res/drawable-1920x900/icon_video.png
正在签名: res/drawable-1920x900/line_content.png
正在签名: res/drawable-1920x900/line_shadow.png
正在签名: res/drawable-1920x900/line_top.png
正在签名: res/drawable-1920x900/line_yellow.png
正在签名: res/drawable-1920x900/nav_flash1.png
正在签名: res/drawable-1920x900/nav_flash2.png
正在签名: res/drawable-1920x900/nav_network1.png
正在签名: res/drawable-1920x900/nav_network2.png
正在签名: res/drawable-1920x900/nav_sata1.png
正在签名: res/drawable-1920x900/nav_sata2.png
正在签名: res/drawable-1920x900/nav_sdcard1.png
正在签名: res/drawable-1920x900/nav_sdcard2.png
正在签名: res/drawable-1920x900/nav_usb1.png
正在签名: res/drawable-1920x900/nav_usb2.png
正在签名: res/drawable-1920x900/popup_win.png
正在签名: res/drawable-1920x900/popup_win1.9.png
正在签名: res/drawable/apk.png
正在签名: res/drawable/audio.png
正在签名: res/drawable/background.png
正在签名: res/drawable/bk.png
正在签名: res/drawable/blank_page.png
正在签名: res/drawable/btn_normal.png
正在签名: res/drawable/btn_pressed.png
正在签名: res/drawable/cifsmanager.png
正在签名: res/drawable/close_b.png
正在签名: res/drawable/content_line.png
正在签名: res/drawable/copy.png
正在签名: res/drawable/device.png
正在签名: res/drawable/device_icon.png
正在签名: res/drawable/dlna.png
正在签名: res/drawable/edit_folder.png
正在签名: res/drawable/explorer_logo.png
正在签名: res/drawable/file_sharing.png
正在签名: res/drawable/flash.png
正在签名: res/drawable/folder.png
正在签名: res/drawable/folder_back.png
正在签名: res/drawable/folder_next.png
正在签名: res/drawable/highlight_disabled.png
正在签名: res/drawable/highlight_pressed.png
正在签名: res/drawable/highlight_selected.png
正在签名: res/drawable/home.png
正在签名: res/drawable/item_flash.png
正在签名: res/drawable/item_hl.png
正在签名: res/drawable/item_sdcard.png
正在签名: res/drawable/item_smb.png
正在签名: res/drawable/item_yellow.png
正在签名: res/drawable/level_up.png
正在签名: res/drawable/line_top.png
正在签名: res/drawable/list.png
正在签名: res/drawable/list_hot.png
正在签名: res/drawable/listbg.9.png
正在签名: res/drawable/listbg_press.9.png
正在签名: res/drawable/main_setting.png
正在签名: res/drawable/menu_edit.png
正在签名: res/drawable/nav_flash1.png
正在签名: res/drawable/nav_flash2.png
正在签名: res/drawable/nav_network1.png
正在签名: res/drawable/nav_network2.png
正在签名: res/drawable/nav_sata1.png
正在签名: res/drawable/nav_sata2.png
正在签名: res/drawable/nav_sdcard1.png
正在签名: res/drawable/nav_sdcard2.png
正在签名: res/drawable/nav_usb1.png
正在签名: res/drawable/nav_usb2.png
正在签名: res/drawable/net_folder.png
正在签名: res/drawable/new_folder.png
正在签名: res/drawable/next_image.png
正在签名: res/drawable/next_image_pressed.png
正在签名: res/drawable/panel_separator.png
正在签名: res/drawable/paste.png
正在签名: res/drawable/popup_blue_border_4.png
正在签名: res/drawable/pre_image.png
正在签名: res/drawable/pre_image_pressed.png
正在签名: res/drawable/rename.png
正在签名: res/drawable/sdcard.png
正在签名: res/drawable/search.png
正在签名: res/drawable/shadow.png
正在签名: res/drawable/share.png
正在签名: res/drawable/smb.png
正在签名: res/drawable/smb_folder_error.png
正在签名: res/drawable/sort.png
正在签名: res/drawable/storage_list.png
正在签名: res/drawable/switch_windows.png
正在签名: res/drawable/tool_background.9.png
正在签名: res/drawable/toolbar_down_arrow.png
正在签名: res/drawable/toolbar_left_arrow.png
正在签名: res/drawable/toolbar_right_arrow.png
正在签名: res/drawable/toolbar_up_arrow.png
正在签名: res/drawable/video.png
正在签名: res/drawable/yellow_border2.9.png
正在签名: res/drawable/yellow_border3.9.png
正在签名: resources.arsc
正在签名: AndroidManifest.xml
正在签名: classes.dex
正在签名: jcifs/http/ne.css
正在签名: jcifs/util/mime.map
正在签名: res/anim/image_in.xml
正在签名: res/anim/image_out.xml
正在签名: res/drawable/editor_btn.xml
正在签名: res/drawable/gradient_line.xml
正在签名: res/drawable/list_selector_background.xml
正在签名: res/drawable/next_images.xml
正在签名: res/drawable/pre_images.xml
正在签名: res/drawable/title_bar_back.xml
正在签名: res/drawable/tool_bar_selector.xml
正在签名: res/drawable/tool_btu.xml
正在签名: res/layout/copy_dialog.xml
正在签名: res/layout/device_adapter.xml
正在签名: res/layout/device_list_item.xml
正在签名: res/layout/editor_layout.xml
正在签名: res/layout/file_details.xml
正在签名: res/layout/main.xml
正在签名: res/layout/new_smb_server.xml
正在签名: res/layout/new_username_password.xml
正在签名: res/layout/normal_adapter.xml
正在签名: res/layout/pictureview.xml
正在签名: res/layout/recovery_dialog.xml
正在签名: res/layout/rename_alert_dialog.xml
正在签名: res/layout/reslover_adapter.xml
正在签名: res/layout/smb_editor_layout.xml
正在签名: res/layout/smb_search_progress.xml
正在签名: res/layout/title_bar.xml
正在签名: res/layout/tool_bar.xml
jar 已签名。
警告:
签名者证书为自签名证书。
未提供 -tsa 或 -tsacert, 此 jar 没有时间戳。如果没有时间戳, 则在签名者证书的到期日期 (2154-09-25) 或以后的任何撤销日期之后, 用户可能无法验证此 jar。
至此使用JKS文件为APK签名完成。
参考资料：
https://stackoverflow.com/questions/5089042/jarsigner-unable-to-sign-jar-java-util-zip-zipexception-invalid-entry-compres
https://blog.csdn.net/HongEnIT/article/details/54583826
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