车臣武装一直是普京的眼中钉肉中刺，普京任代总统期间，发动第二次车臣战争，以图彻底解决车臣问题。但是随着第二次车臣战争的胜利，恐怖事件和反恐战争接踵而至，其斗争之剧烈、场面之惊险、伤亡之惨重，都让人触目惊心。
普京有两把打击恐怖主义活动的坚冰利剑，一个是闻名遐迩的阿尔法特种部队，一个是神秘的信号旗特种支队。两支部队分工不同：阿尔法主要是俄罗斯境内从事反恐活动；信号旗则在国外专门执行特别任务并对俄驻外目标实施安全警戒。
面对车臣恐怖分子的挑衅和暴虐，普京依然发出了“决不向恐怖分子妥协”的呼声，尤其在军队中，一种为了国家牺牲、永不妥协永不放弃的精神更是逐渐成为每个军人最后的坚持。2000年3月在车臣发生的血腥激战就是最好的证明。
2000年3月，在车臣乌鲁斯克尔特地区，90名俄罗斯空降兵战士视死如归，为阻止2000多名车臣匪徒突围，坚持战斗三天三夜，直至打完最后一发子弹，流尽最后一滴血。
整个空降兵连表现出的属于战士的铁血，属于英雄的无畏。那种血腥和残酷，也让民众更加真实的认识到了恐怖分子的含义。
另一恐怖事件发生在莫斯科，震惊世界的莫斯科剧院人质危机成为普京上任两年来最为艰巨的考验。
2002年10月23日晚，莫斯科剧院1000名观众被恐怖分子劫持。恐怖分子疯狂的叫嚣，提出要俄军撤军、释放战俘等要求，否则就引爆莫斯科轴承厂文化宫大楼。
然而谁威胁普京谁就是打错了算盘，普京从来不接受威胁！
普京迅速召开紧急会议，但是他并没有按照惯例安抚人质和受害者家属，而是再次强调了俄罗斯长久以来坚持的“决不向恐怖分子妥协”的政策。
普京在克格勃的经历让他惯于从国家利益至上的观念出发，表现在行动上，则更具有军人的铁血风格。
人质家属开始上街游行，都希望普京能答应绑匪的条件，全国电视台公布人质的呼吁：“我们要求您做出明智的决定”，就连戈尔巴乔夫也出来说话，主张通过谈判解决人质危机。
面对种种压力，普京不为所动，仍坚持强硬立场，普京宣布，俄政府决不向绑匪妥协，决不向车臣叛乱武装让步，绝不让俄军撤离车臣。
最终，阿尔法特种部队开始发动突袭，与寡妇军展开激烈枪战，结果，750名人质被救，34名绑匪被击毙。
这起经历57小时、震惊世界的人质事件至此落下帷幕。营救确实称不上完美，但是普京强硬的态度得到了不少评论人士的肯定。据民意调查，85%以上的俄罗斯公民对普京的行为表示赞同。他展现的品质正是俄罗斯人民渴望已久的。
这次行动也传达给车臣叛军一个信号——对付恐怖分子，决不手软，决不妥协！
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