Bacteria genome denovo assembly

细菌基因组组装金标准：GAGE-B

组装软件的选择

细菌基因组组装的目标不同于大型生物基因组的组装，大型基因组组装的目的是获得一个全局的草图，而细菌基因组组装的目的在于局部的精确拼接，使我们能够对不同的物种或菌株进行比较，从而发现致病菌和非致病菌之间的差异。
不同组装软件有不同特性，一些软件在大型基因组上表现良好，而一些软件适用于小基因组。
这些特征就决定了，对于不同的项目，需要选择不同的软件。