随着基因组测序技术的不断发展，越来越多的物种已完成全基因组密码的破译，在基因组信息全面解析的基础上，对于某物种的功...[作者空间]
1.安装getorganelle 2.安装blast（需依靠其下载各种数据库）先将blast的压缩包下载到Wind...[作者空间]
Wray NR, Kemper KE, Hayes BJ, et al. Complex Trait Predic...[作者空间]
Sun X, Jiao C, Schwaninger H, et al. Phased diploid genom...[作者空间]
EDTA（Extensive de novo TE Annotator）是一个可以从头注释全基因组中的TE并且评估...[作者空间]
SRA数据库: Sequence Read Archive：隶属NCBI (National Center for...[作者空间]
Kachroo P, Eraso J M, Beres S B, et al. 2019. Integrated ...[作者空间]
文中会对遇到的问题进行解答，图表部分也做了比较详细的说明，对初学者比较友好，当然知道实验部分会让你对数据如何得来的...[作者空间]
有很多的生信软件都可以通过conda安装，省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件，conda一行...[作者空间]
注：已经有了fastq.gz格式数据，一个对照，一个突变株，每个处理三个重复。 1 fastqc进行质量控制+结果...[作者空间]
这里的新版指的是PacBio公司在2018年9月发布pb-assembly, 而这篇文章是在2018年9月30日发...[作者空间]
转自：http://www.360doc.com/content/18/0208/11/19913717_7285...[作者空间]
canu - 三代测序组装工具 本文大部分参考或者来自于大神hoptop的简书，在此说明一下。最近由于需要组装三代...[作者空间]
单端测序与双末端测序 高通量测序的方式主要有： 单端测序 paired-end mate-paired(PE/MP...[作者空间]
基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，...[作者空间]
还在羡慕海峡那边的朋友下载SRA 快到飞起？还在难过用wget 下载数据经常下载不完整？用了官方的下载工具还是慢的...[作者空间]
Pfam是蛋白数据库，可以在线比对，但每次只能比对单条序列，非常繁琐。R包bio3d能够实现在R中进行蛋白序列批量...[作者空间]
写在最前面 本次的GATK实战用到的raw data是水稻的，reference是v4版本，具体如下：raw da...[作者空间]
基因组组装完成之后，就需要对最后的质量进行评估。我们希望得到的contig文件中，每个contig都能足够的长，能...[作者空间]
