韦恩图(Venn)是一种用于展示各样本之间共有或特有元素数量的图形。今天,小编就结合R语言中的Venn包和Venn...[作者空间]
基因家族树构建最常用的方法是 NJ 法和 ML 方法,构建进化树之前,需要进行多序列比对。 多序列比对 多序列比对...[作者空间]
本章需要安装的一些模块,可以在CSDN上搜索一下如何安装,其实非常简单,这里我大概举一个例子。 openpyxl ...[作者空间]
基因家族的概念 基因家族 : 来源于同一个祖先,由一个基因通过基因复制而产生的两个或多个拷贝而构成的一组基因,他们...[作者空间]
对于许多做微生物的同学来说,基于高通量测序的16S扩增子测序是对细菌群落组成及多样性进行分析的重要手段。 细菌的1...[作者空间]
https://www.w3schools.com/python/default.asp[https://www....[作者空间]
我是在找snakemake参考资料的时候找到的这本在线电子书,链接是 https://eriqande.githu...[作者空间]
本部分参考自纽普生物(NovoPro) 真核启动子 原核启动子 附:原文链接 https://www.novopr...[作者空间]
我本科是农学,研究生专业是生物学,方向是植物基因组。编程方面真是零基础,仅仅在大一接触C语言。整个课题组基本都是用...[作者空间]
参考教程:http://www.sthda.com/english/wiki/survival-analysis-...[作者空间]
跟着 Microbiome 学画图:堆积柱形图的多层注释[https://mp.weixin.qq.com/s/7...[作者空间]
颜色就是一门语言。 在开始一个新项目的设计时,配色着实让大部分头痛的事情,用什么颜色好?符合不符合产品定位?行业内...[作者空间]
想了一下还是做一个笔记目录,这样能够方便查询 R for Data Science(笔记) ---数据变换(fil...[作者空间]
R语言实现Alpha多样性指数的计算 上次我们已经使用R语言来对OTU表的抽平分析,那么我们如何使用抽平后的OTU...[作者空间]
导读 barrnap预测细菌基因组16S,获取结果文件第二行最长16S,保留>1400bp的16S。mafft做序...[作者空间]
ggplot2绘制-堆叠柱形图参数细讲 昨天我们主要说了如何使用群落微生物的物种属水平丰度表来绘制堆叠柱形图。但是...[作者空间]
venn图在论文中的作用与地位也许不如其它图形那么重要,因此本文主要不是教大家如何画一个高端的venn图,而是通过...[作者空间]
本节我们来绘制微生物的物种组成图;先通过phyloseq包整合数据,之后利用MicrobiotaProcess包绘...[作者空间]
https://www.cedricscherer.com/2019/08/05/a-ggplot2-tutori...[作者空间]
自己网上整理 的 ,分享给大家!用上的麻烦点个赞啦,谢谢!根据染色体起始终止点坐标来获取碱基序列 http://w...[作者空间]